RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 KCNJ8Q15842 424 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 MICBQ29980 383 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 ODF4Q2M2E3 257 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 AWAT1Q58HT5 328 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 MOB3CQ70IA8 216 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 ASRGL1Q7L266 308 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 ZNF679Q8IYX0 411 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 LHX4Q969G2 390 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 UBE2FQ969M7 185 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 WDFY2Q96P53 400 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 ZNF391Q9UJN7 358 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 SLC22A13Q9Y226 551 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 A0A0U1RQV5 110 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 ZNF732B4DXR9 585 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 P2RY10O00398 339 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 NDUFA2O43678 99 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 OMGP23515 440 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 MAP2K3P46734 347 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 STUMQ69YW2 141 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 C3orf56Q8N813 242 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 ASB17Q8WXJ9 295 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 ZNF488Q96MN9 340 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 GAFA1Q96PS6 74 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 OR51I2Q9H344 312 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 GPR173Q9NS66 373 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 HAO2Q9NYQ3 351 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 AASSQ9UDR5 926 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 PIGLQ9Y2B2 252 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 A0A1B0GTI1 187 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PRD5 423 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PRF3 423 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PRM7 423 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 H3BNX3 289 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 SYNGR1O43759 233 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 ZNF254O75437 659 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 CIB2O75838 187 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 HKR1P10072 659 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 GLRA1P23415 457 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 GABRA2P47869 451 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 TGM4P49221 684 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 KLRD1Q13241 179 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 DGUOKQ16854 277 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 FAM76BQ5HYJ3 339 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 GPR157Q5UAW9 335 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 METTL11BQ5VVY1 283 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 CD276Q5ZPR3 534 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 DEGS2Q6QHC5 323 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 FTMTQ8N4E7 242 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 AQP3Q92482 292 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 CNTD2Q9H8S5 307 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 SIRT7Q9NRC8 400 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 CLN6Q9NWW5 311 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 ONECUT1Q9UBC0 465 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 R4GMQ9 66 aa8.75□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 TMEM210A6NLX4 147 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 EI24O14681 340 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 NDUFB3O43676 98 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 DHRS3O75911 302 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 NRASP01111 189 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 FCGR1AP12314 374 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 MTNR1AP48039 350 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 GNG3P63215 75 aa8.74□□□□□ -1.01
NELFE-213ENST00000494956 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms