RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261980.2

VSX2-201, Transcript of visual system homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX2, Length 2,995 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2-201ENST00000261980 OR2A5Q96R48 311 aa14.61□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.61□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 A0A1W2PP55 124 aa14.61□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 HLA-DOBP13765 273 aa14.61□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa14.61□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 PTPRSQ13332 1948 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 LTBP2Q14767 1821 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 LILRB3O75022 631 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 NPSP0C0P6 89 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 CXCR1P25024 350 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 CD200P41217 278 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 FXYD4P59646 89 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 RND3P61587 244 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 SHHQ15465 462 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 CATSPERDQ86XM0 798 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 FAM3CQ92520 227 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 ADAM10O14672 748 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 TAAR5O14804 337 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 GZMBP10144 247 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 FUT3P21217 361 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 YPEL4Q96NS1 127 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 FBRSQ9HAH7 460 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 MEMO1Q9Y316 297 aa14.6□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 ZNF264O43296 627 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 ANOS1P23352 680 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 HNF4GQ14541 408 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 AGBL4Q5VU57 503 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 C1QL4Q86Z23 238 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 TMEM217Q8N7C4 229 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 BCORP1Q8N888 145 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 FAM210BQ96KR6 192 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 OR2M4Q96R27 311 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 SNHG12Q9BXW3 62 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 RTN4RQ9BZR6 473 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 UCK1Q9HA47 277 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 LINC01553A4QN01 128 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 ZNF724A8MTY0 619 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 CYR61O00622 381 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 OR5H8P0DN80 308 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 ADH5P11766 374 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 TMEM50BP56557 158 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 Q9N2J8 555 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.59□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 H0Y8X5 98 aa14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 SYT7O43581 403 aa14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 DEDDO75618 318 aa14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 RUNX1Q01196 453 aa14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 PHLDA2Q53GA4 152 aa14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 OPN5Q6U736 354 aa14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.58□□□□□ -0.07
VSX2-201ENST00000261980 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 HCRTR2O43614 444 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 OR4A8P0C604 315 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 ASAH2BP0C7U1 165 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 MPZP25189 248 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 SLC37A1P57057 533 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 FAM3AP98173 230 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 FIGLAQ6QHK4 219 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 STT3BQ8TCJ2 826 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 FGF22Q9HCT0 170 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 RBFOX3A6NFN3 312 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 RAB1AP62820 205 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 PHF19Q5T6S3 580 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.58□□□□□ -0.08
VSX2-201ENST00000261980 OR2G3Q8NGZ4 309 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.9 ms