RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CALHM2Q9HA72 323 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0A6YYD4 124 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF587BE7ETH6 402 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CYB5AP00167 134 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 LCATP04180 440 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 NAT2P11245 290 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CPN1P15169 458 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ACKR3P25106 362 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 PTGFRP43088 359 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 RAD52P43351 418 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 C3AR1Q16581 482 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CDNFQ49AH0 187 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 IGFL2Q6UWQ7 119 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CHST4Q8NCG5 386 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR8S1Q8NH09 359 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CMBLQ96DG6 245 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 HYLS1Q96M11 299 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 GINS4Q9BRT9 223 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 NICN1Q9BSH3 213 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB127Q9H1M4 99 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 RGCCQ9H4X1 137 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 LDAHQ9H6V9 325 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF222Q9UK12 451 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 NPTNQ9Y639 398 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 DOCK7Q96N67 2140 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 FABP7O15540 132 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SSNA1O43805 119 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 RAB3DO95716 219 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 MPIG6BO95866 241 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 UCNP55089 124 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 TMPRSS3P57727 454 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.271e-7■■□□□ 14.5
PDE4D-208ENST00000502484 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF626Q68DY1 528 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 FJX1Q86VR8 437 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF584Q8IVC4 421 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 APH1AQ96BI3 265 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CST11Q9H112 138 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CSAG2Q9Y5P2 127 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PP11 408 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SMLR1H3BR10 107 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 FCER2P06734 321 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF735P0CB33 412 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 GNB3P16520 340 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZP1P60852 638 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 DMRTC1Q5HYR2 192 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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PDE4D-208ENST00000502484 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 NPRL2Q8WTW4 380 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SPSB1Q96BD6 273 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 BANF2Q9H503 90 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 UPB1Q9UBR1 384 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 SPTA1P02549 2419 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 K7ENP7 123 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 AMY2AP04746 511 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 COX5BP10606 129 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 FCGR2AP12318 317 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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