RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa1.56□□□□□ -2.16
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR21Q99679 349 aa1.56□□□□□ -2.16
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM185BQ9H7F4 350 aa1.56□□□□□ -2.16
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VSIRQ9H7M9 311 aa1.56□□□□□ -2.16
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HPCAL4Q9UM19 191 aa1.56□□□□□ -2.16
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C2orf16Q68DN1 1984 aa1.56□□□□□ -2.16
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCG5Q9H222 651 aa1.53□□□□□ -2.16
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa1.53□□□□□ -2.16
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR2B8PP59922 312 aa1.52□□□□□ -2.17
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC8AQ8IWT6 810 aa1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GABRG1Q8N1C3 465 aa1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PQLC3Q8N755 202 aa1.52□□□□□ -2.17
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SFXN5Q8TD22 340 aa1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 YIPF5Q969M3 257 aa1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMARCD1Q96GM5 515 aa1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNF8Q96H20 258 aa1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CSPG4P5Q96PW8 444 aa1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GSDMAQ96QA5 445 aa1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLIN2Q99541 437 aa1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC77Q9BR77 488 aa1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INIPQ9NRY2 104 aa1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB23Q9ULC3 237 aa1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SAR1BQ9Y6B6 198 aa1.52□□□□□ -2.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MROH7Q68CQ1 1323 aa1.51□□□□□ -2.17
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