RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 UFSP2Q9NUQ7 469 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 MIOXQ9UGB7 285 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GWJ7 208 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 IFNL4K9M1U5 179 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 RGS10O43665 173 aa10.52□□□□□ -0.73
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PRAME-212ENST00000485532 IGHA1P01876 353 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 HLA-DQA2P01906 255 aa10.52□□□□□ -0.73
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PRAME-212ENST00000485532 TMEM80Q96HE8 168 aa10.52□□□□□ -0.73
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PRAME-212ENST00000485532 TSPAN14Q8NG11 270 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 OR10H4Q8NGA5 316 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 OR6N2Q8NGY6 317 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 OR2AE1Q8NHA4 323 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 ZNF649Q9BS31 505 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 JAM3Q9BX67 310 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 YIPF3Q9GZM5 350 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 CTSZQ9UBR2 303 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 COPS3Q9UNS2 423 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 TRIM64CA6NLI5 447 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 PRR32B1ATL7 298 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 SFTPBP07988 381 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 LIMS3P0CW19 117 aa10.5□□□□□ -0.73
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PRAME-212ENST00000485532 CD200P41217 278 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 ETV1P50549 477 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 ZNF85Q03923 595 aa10.5□□□□□ -0.73
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PRAME-212ENST00000485532 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 TEX30Q5JUR7 227 aa10.5□□□□□ -0.73
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PRAME-212ENST00000485532 SPATC1Q76KD6 591 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 C1orf87Q8N0U7 546 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 ACBD7Q8N6N7 88 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 TBX5Q99593 518 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 CDCA4Q9BXL8 241 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 CLN8Q9UBY8 286 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 KCNG2Q9UJ96 466 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 A0A087WXM4 84 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 CD300LBA8K4G0 201 aa10.49□□□□□ -0.73
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