RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR2AT4A6NND4 320 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RHBDL1O75783 438 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RENP00797 406 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COX7A1P24310 79 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 YAP1P46937 504 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GABRA2P47869 451 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A1P53007 311 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERVFRD-1P60508 538 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SELENOWP63302 87 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL5RAQ01344 420 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBPL2Q6SJ96 375 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DYNAPQ8N1N2 210 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM185AQ8NFB2 350 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MICU1Q9BPX6 476 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USE1Q9NZ43 259 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NLKQ9UBE8 527 aa13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SACSQ9NZJ4 4579 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANXA2P2A6NMY6 339 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF823P16415 610 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NOS3P29474 1203 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KDELR2P33947 212 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNCBQ16143 134 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NANOGP8Q6NSW7 305 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBTB46Q86UZ6 589 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FTMTQ8N4E7 242 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNRF1Q8ND25 227 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR52H1Q8NGJ2 320 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TFAP2CQ92754 450 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C7orf26Q96N11 449 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RTL8AQ9BWD3 113 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD19PQ9H560 264 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C19orf12Q9NSK7 152 aa13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM210A6NLX4 147 aa13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 J3KTA2 159 aa13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FFAR1O14842 300 aa13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKR7A2O43488 359 aa13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TFF1P04155 84 aa13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANOS1P23352 680 aa13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL31P62899 125 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSX2Q16385 188 aa13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AGBL2Q5U5Z8 902 aa13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC16A9Q7RTY1 509 aa13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C11orf42Q8N5U0 333 aa13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKR1E2Q96JD6 320 aa13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASCL2Q99929 193 aa13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COPS4Q9BT78 406 aa13.24□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARG1P05089 322 aa13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFL1P23528 166 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHATP28329 748 aa13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 THBS3P49746 956 aa13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAPZA1P52907 286 aa13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GP2P55259 537 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR12D2P58182 307 aa13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM3AP98173 230 aa13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C16orf82Q7Z2V1 217 aa13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR8J3Q8NGG0 315 aa13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NMNAT3Q96T66 252 aa13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNJ15Q99712 375 aa13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF649Q9BS31 505 aa13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCB9Q9NP78 766 aa13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNX13Q9Y5W8 968 aa13.23□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC2A1P11166 492 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLRA1P23415 457 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC6A1P30531 599 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRKXP51817 358 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAF13Q15543 124 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TIGD6Q17RP2 521 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM200BQ69YZ2 307 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMARCD3Q6STE5 483 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ETV3LQ6ZN32 361 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CALHM1Q8IU99 346 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR13D1Q8NGV5 346 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAPSLQ8WWF8 208 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SDSLQ96GA7 329 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SP140LQ9H930 580 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPC1Q9Y5U8 109 aa13.22□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ODF3BA8MYP8 253 aa13.21□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBX1O43435 398 aa13.21□□□□□ -0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSG2P11465 335 aa13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms