RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 BCL2L15Q5TBC7 163 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 XAF1Q6GPH4 301 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 BRICD5Q6PL45 260 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 DRAM2Q6UX65 266 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC30A7Q8NEW0 376 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 OR10S1Q8NGN2 331 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 FGFBP3Q8TAT2 258 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 PGAM5Q96HS1 289 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 DOK1Q99704 481 aa9.86□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 BRD7Q9NPI1 651 aa9.86□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 TBX1O43435 398 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 ABHD16AO95870 558 aa9.85□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 PRTN3P24158 256 aa9.85□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 ASPHD2Q6ICH7 369 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 COMMD2Q86X83 199 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 MUC15Q8N387 334 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF676Q8N7Q3 588 aa9.85□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZFP41Q8N8Y5 198 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 WDR31Q8NA23 367 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 IL17RDQ8NFM7 739 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa9.85□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 B3GNT2Q9NY97 397 aa9.85□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 MMP24Q9Y5R2 645 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC25A15Q9Y619 301 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 PLCE1Q9P212 2302 aa9.84□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 B4DSR2 109 aa9.84□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 LCATP04180 440 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 TFAP2AP05549 437 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 CPEP16870 476 aa9.84□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF83P51522 516 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 GPR50Q13585 617 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 CDK5R1Q15078 307 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAM1Q15629 374 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 C3orf36Q3SXR2 165 aa9.84□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 FAM57BQ71RH2 274 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 OR5AK2Q8NH90 309 aa9.84□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 OPALINQ96PE5 141 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 OR10A2Q9H208 303 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 NOX3Q9HBY0 568 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 HIF1ANQ9NWT6 349 aa9.84□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1B0GVI7 797 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 DPRXA6NFQ7 191 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 OGG1O15527 345 aa9.83□□□□□ -0.84
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CAPNS1-209ENST00000590049 IGKV3-15P01624 115 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 CRYAAP02489 173 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 DBHP09172 617 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 ACSM4P0C7M7 580 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC2A1P11166 492 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-209ENST00000590049 CD36P16671 472 aa9.83□□□□□ -0.84
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