RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-211ENST00000467464 SLC25A19Q9HC21 320 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-211ENST00000467464 ERVK-18Q9QC07 812 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRF-211ENST00000467464 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 CCDC182A6NF36 153 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 A6NLC8 198 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PRR32B1ATL7 298 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 SRRM5B3KS81 715 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 DVL1O14640 695 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 TMPRSS2O15393 492 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 FKBP6O75344 327 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 H2BFMP0C1H6 154 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 GFOD2Q3B7J2 385 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 CD276Q5ZPR3 534 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 OR8B12Q8NGG6 310 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 OR8S1Q8NH09 359 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 SGMS2Q8NHU3 365 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 LRRC29Q8WV35 223 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 SLC25A28Q96A46 364 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 OTULINQ96BN8 352 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 WDFY2Q96P53 400 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 OR10A2Q9H208 303 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 RGCCQ9H4X1 137 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 SP140LQ9H930 580 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 BRD7Q9NPI1 651 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 POMPQ9Y244 141 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 P2RY10O00398 339 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 TIPRLO75663 272 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 APOC1P02654 83 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 HMGN1P05114 100 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 LYNP07948 512 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ANXA8P13928 327 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ALOX5APP20292 161 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 DCTDP32321 178 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 HCCSP53701 268 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 BPIFB3P59826 476 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 CBX1P83916 185 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 MZT1Q08AG7 82 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 FLOT2Q14254 428 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 WDR38Q5JTN6 314 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 SLC35D3Q5M8T2 416 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PRR31Q5SQ13 230 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 GPR157Q5UAW9 335 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 STUMQ69YW2 141 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 FAHD1Q6P587 224 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 BTN2A1Q7KYR7 527 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 GALNT4Q8N4A0 578 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 LY6G5BQ8NDX9 201 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 THEM6Q8WUY1 208 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 OR5P3Q8WZ94 311 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PGAM5Q96HS1 289 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 CCL13Q99616 98 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PCGF1Q9BSM1 259 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 DNAJB9Q9UBS3 223 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 LRP12Q9Y561 859 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 GNGT2O14610 69 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 CDIPTO14735 213 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 TOX4O94842 621 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 CST4P01036 141 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 IGLV3-1P01715 115 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 LIPFP07098 398 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 MELTFP08582 738 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 SELLP14151 372 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 TGM4P49221 684 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 DAPP51397 102 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 IL13RA1P78552 427 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 RELBQ01201 579 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 PRDX4Q13162 271 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 APOFQ13790 326 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 MICBQ29980 383 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 DNAL1Q4LDG9 190 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 C16orf87Q6PH81 154 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 Q6YL49 198 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 FAM216BQ8N7L0 139 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-211ENST00000467464 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms