RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 THEM6Q8WUY1 208 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 TECTBQ96PL2 329 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 ABCB9Q9NP78 766 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 POMPQ9Y244 141 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 P2RY10O00398 339 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 SELENOFO60613 162 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 CST4P01036 141 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 ALOX5APP20292 161 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 PRKACGP22612 351 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 SLC2A5P22732 501 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 GNALP38405 381 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 MICBQ29980 383 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 FAM76BQ5HYJ3 339 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 DEGS2Q6QHC5 323 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 WDR86Q86TI4 376 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 ITPKCQ96DU7 683 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 PGAM5Q96HS1 289 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF747Q9BV97 191 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 ACOD1A6NK06 481 aa14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 GYPAP02724 150 aa14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 MMP9P14780 707 aa14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 GPR157Q5UAW9 335 aa14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 WDR82Q6UXN9 313 aa14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 MICU1Q9BPX6 476 aa14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 NOX4Q9NPH5 578 aa14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-201ENST00000330334 MGAM2Q2M2H8 2515 aa14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM210A6NLX4 147 aa14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 DVL1O14640 695 aa14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 GPR37O15354 613 aa14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 DCTDP32321 178 aa14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 FAHD1Q6P587 224 aa14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 LRRC29Q8WV35 223 aa14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 WDFY2Q96P53 400 aa14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 DUX5Q96PT3 197 aa14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 TEAD3Q99594 435 aa14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 BRD7Q9NPI1 651 aa14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 A0A0U1RQV5 110 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 POM121CA8CG34 1229 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 SRRM5B3KS81 715 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 TMPRSS2O15393 492 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 GSC2O15499 205 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 FCN3O75636 299 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 TOX4O94842 621 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 EGR1P18146 543 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 ACKR3P25106 362 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 CRISP1P54107 249 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 IL13RA1P78552 427 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 PDCD1Q15116 288 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 SNAPC1Q16533 368 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 C16orf87Q6PH81 154 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 BBS1Q8NFJ9 593 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 OR5P3Q8WZ94 311 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 LYZL4Q96KX0 146 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 TBX15Q96SF7 602 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 RTL8AQ9BWD3 113 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 LAMP5Q9UJQ1 280 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 LRP12Q9Y561 859 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 CDIPTO14735 213 aa14.68□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF254O75437 659 aa14.68□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 RPS7P62081 194 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 ESRRGP62508 458 aa14.68□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 CSNK2BP67870 215 aa14.68□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 ROM1Q03395 351 aa14.68□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 APOFQ13790 326 aa14.68□□□□□ -0.06
HDDC3-201ENST00000330334 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms