RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 PI16Q6UXB8 463 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-87P-201ENST00000607561 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-87P-201ENST00000607561 NXPE3Q969Y0 559 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRIM11Q96F44 468 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-87P-201ENST00000607561 NPHS2Q9NP85 383 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 BAG6P46379 1132 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 TCF12Q99081 682 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLVAPQ9BX97 442 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 RNF19AQ9NV58 838 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 METTL12A8MUP2 240 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 GNB5O14775 395 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 MSL1Q68DK7 614 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCNJLQ8IV13 435 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 ADAM19Q9H013 955 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 CDC27P30260 824 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 GRIA4P48058 902 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 GRM2Q14416 872 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 PODNQ7Z5L7 613 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 FBF1Q8TES7 1133 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 EHD4Q9H223 541 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.24□□□□□ -1.41
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RNU6-87P-201ENST00000607561 PTPRAP18433 802 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 COL8A1P27658 744 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATP2B2Q01814 1243 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 RGS22Q8NE09 1264 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 BCO2Q9BYV7 579 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.23□□□□□ -1.41
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RNU6-87P-201ENST00000607561 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 BSNDQ8WZ55 320 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 MUC3BQ9H195 1237 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 SOX13Q9UN79 622 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 PPME1Q9Y570 386 aa6.22□□□□□ -1.41
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RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM229AH3BQW9 127 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 LINC01387J3KSC0 135 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 PIK3R2O00459 728 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 EPHA1P21709 976 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 CDC25BP30305 580 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 GSK3AP49840 483 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 ABCB6Q9NP58 842 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 PARP2Q9UGN5 583 aa6.21□□□□□ -1.42
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RNU6-87P-201ENST00000607561 HGSNATQ68CP4 663 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.2□□□□□ -1.42
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RNU6-87P-201ENST00000607561 GIPC1O14908 333 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 ITPKAP23677 461 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 GNA15P30679 374 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 DAB2P98082 770 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 FGD1P98174 961 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 KCNMA1Q12791 1236 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 FBXO11Q86XK2 927 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 GIPC2Q8TF65 315 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 FRMD6Q96NE9 622 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 H3BRJ5 948 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 FSCN2O14926 492 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-87P-201ENST00000607561 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
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