RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593701.5

SLC27A1-202, Transcript of solute carrier family 27 member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SLC27A1, Length 688 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1-202ENST00000593701 RGS19P49795 217 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 CSRNP1Q96S65 589 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 MED23Q9ULK4 1368 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.17■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.17■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.17■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.17■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 FBXW7Q969H0 707 aa25.17■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 STK31Q9BXU1 1019 aa25.17■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.16■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 CCDC27Q2M243 656 aa25.16■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.16■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 ANP32CO43423 234 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 KLRK1P26718 216 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 DACT2Q5SW24 774 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 WWC1Q8IX03 1113 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.15■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.14■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 H7C1W4 665 aa25.14■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 SLC4A2P04920 1241 aa25.14■■□□□ 1.62
SLC27A1-202ENST00000593701 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.14■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.13■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 MRS2Q9HD23 443 aa25.13■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 ITGA6P23229 1130 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 WNT10BO00744 389 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 SASH1O94885 1247 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 CASP7P55210 303 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 GCKRQ14397 625 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 COA1Q9GZY4 146 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 FKBP1BP68106 108 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 FLIIQ13045 1269 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 SNAP23O00161 211 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC27A1-202ENST00000593701 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.08■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 OGFOD1Q8N543 542 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 IL16Q14005 1332 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 CSF1RP07333 972 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 SOX10P56693 466 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 GTF2IP78347 998 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 CHRNDQ07001 517 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 PRKG1Q13976 671 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 TBC1D8O95759 1140 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 LINS1Q8NG48 757 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 FZD1Q9UP38 647 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 TAF5LO75529 589 aa25.02■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SLC27A1-202ENST00000593701 F6X3S4 739 aa25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 VAMP4O75379 141 aa25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 KCNJ4P48050 445 aa25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 CD209Q9NNX6 404 aa25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.01■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 CERS5Q8N5B7 392 aa25■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 A0A1B0GUL6 1792 aa24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 SLC34A2O95436 690 aa24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 NF2P35240 595 aa24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 FOXO4P98177 505 aa24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.99■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 WDR63Q8IWG1 891 aa24.98■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.98■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 JAG2Q9Y219 1238 aa24.97■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 F8W031 263 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 TM4SF4P48230 202 aa24.96■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.96■■□□□ 1.59
SLC27A1-202ENST00000593701 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SLC27A1-202ENST00000593701 BEND3Q5T5X7 828 aa24.95■■□□□ 1.58
SLC27A1-202ENST00000593701 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.95■■□□□ 1.58
SLC27A1-202ENST00000593701 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms