RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589485.5

ILF3-215, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2

Gene ILF3, Length 620 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-215ENST00000589485 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.94■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.94■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 TRIM27P14373 513 aa25.93■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.93■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 PASKQ96RG2 1323 aa25.92■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.91■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.91■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.91■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.91■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.9■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.9■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.9■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 MEIS3Q99687 375 aa25.9■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 TNNQ9UQP3 1299 aa25.9■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 METTL24Q5JXM2 366 aa25.89■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 CREBZFQ9NS37 354 aa25.89■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.89■■□□□ 1.74
ILF3-215ENST00000589485 GNAI3P08754 354 aa25.88■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 LRRC24Q50LG9 513 aa25.88■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.88■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.88■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 CD209Q9NNX6 404 aa25.88■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 ZNF609O15014 1411 aa25.88■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.87■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.87■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 UBE4AQ14139 1066 aa25.87■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 DACT2Q5SW24 774 aa25.87■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.87■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 KLRG1Q96E93 195 aa25.87■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.87■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 USP17L8P0C7I0 530 aa25.86■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 GTF2IP78347 998 aa25.86■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.86■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.86■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 MXD3Q9BW11 206 aa25.85■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.85■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 EGFRP00533 1210 aa25.84■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 GMLQ99445 158 aa25.84■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 EYA2O00167 538 aa25.83■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 TRAF5O00463 557 aa25.83■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.83■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
ILF3-215ENST00000589485 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.722e-7■□□□□ 10.1
ILF3-215ENST00000589485 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.82■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 OGFOD1Q8N543 542 aa25.82■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 SIL1Q9H173 461 aa25.82■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.82■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 PDE8BO95263 885 aa25.81■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 IL1R1P14778 569 aa25.81■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 GYG1P46976 350 aa25.81■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 VPS37DQ86XT2 251 aa25.8■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 GNAI2P04899 355 aa25.79■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 USP48Q86UV5 1035 aa25.79■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.79■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.79■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 SCARF1Q14162 830 aa25.78■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.78■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.78■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.78■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 GGA3Q9NZ52 723 aa25.78■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 FBXO3Q9UK99 471 aa25.78■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 JAG2Q9Y219 1238 aa25.78■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 SRGAP3O43295 1099 aa25.77■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.77■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.77■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
ILF3-215ENST00000589485 CIAO1O76071 339 aa25.76■■□□□ 1.71
ILF3-215ENST00000589485 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
ILF3-215ENST00000589485 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
ILF3-215ENST00000589485 MMP14P50281 582 aa25.76■■□□□ 1.71
ILF3-215ENST00000589485 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.76■■□□□ 1.71
ILF3-215ENST00000589485 CNTNAP1P78357 1384 aa25.75■■□□□ 1.71
ILF3-215ENST00000589485 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
ILF3-215ENST00000589485 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
ILF3-215ENST00000589485 SASH1O94885 1247 aa25.75■■□□□ 1.71
ILF3-215ENST00000589485 SLC5A1P13866 664 aa25.75■■□□□ 1.71
ILF3-215ENST00000589485 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
ILF3-215ENST00000589485 SULF1Q8IWU6 871 aa25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms