RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 COA1Q9GZY4 146 aa23.27■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.26■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.26■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L3A6NCW0 530 aa23.25■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L4A6NCW7 530 aa23.25■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 METTL24Q5JXM2 366 aa23.25■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.25■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 MICALL2Q8IY33 904 aa23.25■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 DPF2Q92785 391 aa23.25■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.24■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.23■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 EYA2O00167 538 aa23.23■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 GNAI2P04899 355 aa23.23■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 PANK1Q8TE04 598 aa23.23■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 FBXW7Q969H0 707 aa23.23■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 MXD3Q9BW11 206 aa23.23■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 SIL1Q9H173 461 aa23.23■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 CD209Q9NNX6 404 aa23.23■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 H7C1D1 291 aa23.22■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 UBE4AQ14139 1066 aa23.22■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.22■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.22■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.22■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 PDE8BO95263 885 aa23.21■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 DACT2Q5SW24 774 aa23.21■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.21■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.21■■□□□ 1.31
GCSHP2-201ENST00000560971 SRGAP3O43295 1099 aa23.2■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 EGFRP00533 1210 aa23.2■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 APLP1P51693 650 aa23.2■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 HTRA3P83110 453 aa23.2■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.2■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 CNTROBQ8N137 903 aa23.2■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.2■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 GMLQ99445 158 aa23.2■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 GYG1P46976 350 aa23.19■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 GTF2IP78347 998 aa23.19■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 MTX1Q13505 466 aa23.19■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.19■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.19■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 PSME4Q14997 1843 aa23.18■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 IL1R1P14778 569 aa23.18■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 COPRSQ9NQ92 184 aa23.18■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.17■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 CIAO1O76071 339 aa23.17■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF609O15014 1411 aa23.16■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 PASKQ96RG2 1323 aa23.16■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L8P0C7I0 530 aa23.16■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 FBXO3Q9UK99 471 aa23.16■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 JAG2Q9Y219 1238 aa23.16■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 MS4A1P11836 297 aa23.15■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 FGFR2P21802 821 aa23.15■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
GCSHP2-201ENST00000560971 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.14■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.14■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.14■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.14■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 CERS5Q8N5B7 392 aa23.13■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 COG6Q9Y2V7 657 aa23.13■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.12■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 TRAF5O00463 557 aa23.12■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 SASH1O94885 1247 aa23.12■■□□□ 1.29
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GCSHP2-201ENST00000560971 BCAMP50895 628 aa23.12■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.12■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 VPS37DQ86XT2 251 aa23.12■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.12■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.12■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP8B2P98198 1209 aa23.11■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.11■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 LPIN2Q92539 896 aa23.11■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC5A1P13866 664 aa23.1■■□□□ 1.29
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