RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 H7C1D1 291 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 EGFRP00533 1210 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 KCNJ4P48050 445 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 KLRG1Q96E93 195 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 GMLQ99445 158 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 CREBZFQ9NS37 354 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 TNNQ9UQP3 1299 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 USP17L3A6NCW0 530 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 USP17L4A6NCW7 530 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 TRIM27P14373 513 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.27■■□□□ 1.16
CS-219ENST00000550655 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 DACT2Q5SW24 774 aa22.26■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.26■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 MEIS3Q99687 375 aa22.26■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 PLIN1O60240 522 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 LRRC24Q50LG9 513 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.25■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 TRAF5O00463 557 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 MXD3Q9BW11 206 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 CD209Q9NNX6 404 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 UBE4AQ14139 1066 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 JMYQ8N9B5 988 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 USP17L8P0C7I0 530 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 IL1R1P14778 569 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 FBXW7Q969H0 707 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 CNTNAP1P78357 1384 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-219ENST00000550655 GTF2IP78347 998 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 METTL24Q5JXM2 366 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.19■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.19■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 EYA2O00167 538 aa22.18■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 PDE8BO95263 885 aa22.18■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 GNAI3P08754 354 aa22.18■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 CST9Q5W186 159 aa22.18■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.18■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.18■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 GYG1P46976 350 aa22.17■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.17■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 CERS5Q8N5B7 392 aa22.17■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.17■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 GGA3Q9NZ52 723 aa22.17■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 RASSF10A6NK89 507 aa22.16■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 PCNTO95613 3336 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 ADM5C9JUS6 153 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 MTX1Q13505 466 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 DLK2Q6UY11 383 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 USP48Q86UV5 1035 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.14■■□□□ 1.14
CS-219ENST00000550655 CIAO1O76071 339 aa22.14■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 FGFR2P21802 821 aa22.14■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 SCARF1Q14162 830 aa22.14■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 SIL1Q9H173 461 aa22.14■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 FBXO3Q9UK99 471 aa22.14■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 RLBP1P12271 317 aa22.13■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CS-219ENST00000550655 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms