RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545825.1

CCDC189-211, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC189, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-211ENST00000545825 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
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CCDC189-211ENST00000545825 MROH5Q6ZUA9 1318 aa28.16■■■□□ 2.1
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CCDC189-211ENST00000545825 USP17L1Q7RTZ2 530 aa28.13■■■□□ 2.09
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CCDC189-211ENST00000545825 UBE4AQ14139 1066 aa28.12■■■□□ 2.09
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CCDC189-211ENST00000545825 TRPM4Q8TD43 1214 aa28.11■■■□□ 2.09
CCDC189-211ENST00000545825 CD209Q9NNX6 404 aa28.11■■■□□ 2.09
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CCDC189-211ENST00000545825 CNTROBQ8N137 903 aa28.09■■■□□ 2.09
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CCDC189-211ENST00000545825 PASKQ96RG2 1323 aa28.09■■■□□ 2.09
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CCDC189-211ENST00000545825 GNAI2P04899 355 aa28.08■■■□□ 2.09
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CCDC189-211ENST00000545825 SAMD7Q7Z3H4 446 aa28.08■■■□□ 2.09
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF804AQ7Z570 1209 aa28.08■■■□□ 2.09
CCDC189-211ENST00000545825 EGFRP00533 1210 aa28.07■■■□□ 2.08
CCDC189-211ENST00000545825 IL1R1P14778 569 aa28.07■■■□□ 2.08
CCDC189-211ENST00000545825 HTRA3P83110 453 aa28.07■■■□□ 2.08
CCDC189-211ENST00000545825 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.07■■■□□ 2.08
CCDC189-211ENST00000545825 MXD3Q9BW11 206 aa28.07■■■□□ 2.08
CCDC189-211ENST00000545825 TTLL5Q6EMB2 1281 aa28.06■■■□□ 2.08
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CCDC189-211ENST00000545825 FBXW7Q969H0 707 aa28.06■■■□□ 2.08
CCDC189-211ENST00000545825 SIL1Q9H173 461 aa28.06■■■□□ 2.08
CCDC189-211ENST00000545825 PGAP2Q9UHJ9 254 aa28.06■■■□□ 2.08
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CCDC189-211ENST00000545825 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
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CCDC189-211ENST00000545825 CAVIN4Q5BKX8 364 aa27.96■■■□□ 2.07
CCDC189-211ENST00000545825 VPS37DQ86XT2 251 aa27.96■■■□□ 2.07
CCDC189-211ENST00000545825 KIAA0825Q8IV33 1275 aa27.96■■■□□ 2.07
CCDC189-211ENST00000545825 OGFOD1Q8N543 542 aa27.96■■■□□ 2.07
CCDC189-211ENST00000545825 SLC5A1P13866 664 aa27.95■■■□□ 2.06
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CCDC189-211ENST00000545825 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
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