RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544910.5

VPS50-220, Transcript of VPS50, EARP/GARPII complex subunit, humanhuman

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Gene VPS50, Length 5,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50-220ENST00000544910 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 KRT23Q9C075 422 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 A0A1B0GUL7 405 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 PTPN14Q15678 1187 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 MFSD6Q6ZSS7 791 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 PPFIA3O75145 1194 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 TNNT1P13805 278 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CLEC17AQ6ZS10 378 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 ADCY9O60503 1353 aa6.7□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CCDC152Q4G0S7 254 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 C3P01024 1663 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CHST3Q7LGC8 479 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CNNM3Q8NE01 707 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 GTF3C6Q969F1 213 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 HAUS7Q99871 368 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 ALG1Q9BT22 464 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.342e-6■■■■□ 23.6
VPS50-220ENST00000544910 ABCF2Q9UG63 623 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 MTMR7Q9Y216 660 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CFAP100Q494V2 611 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 MICU3Q86XE3 530 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 XAGE2Q96GT9 111 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 BRAPQ7Z569 592 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 MTMR6Q9Y217 621 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 AKAP12Q02952 1782 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 ZBTB43O43298 467 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 TMC6Q7Z403 805 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 RASEFQ8IZ41 740 aa6.69□□□□□ -1.34
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VPS50-220ENST00000544910 MAP4K1Q92918 833 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CEP89Q96ST8 783 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.69□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.68□□□□□ -1.34
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VPS50-220ENST00000544910 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 LUZP1Q86V48 1076 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 BIN1O00499 593 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CEP135Q66GS9 1140 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.68□□□□□ -1.34
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VPS50-220ENST00000544910 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 ERBB3P21860 1342 aa6.68□□□□□ -1.34
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VPS50-220ENST00000544910 ZSCAN12O43309 604 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 RAD21O60216 631 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 GNAT2P19087 354 aa6.68□□□□□ -1.34
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VPS50-220ENST00000544910 SYKP43405 635 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 TIMM10P62072 90 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.68□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 PTGS1P23219 599 aa6.67□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 ITGA6P23229 1130 aa6.67□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 WTAPQ15007 396 aa6.67□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.67□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 MTX1Q13505 466 aa6.67□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 STIM1Q13586 685 aa6.67□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 KIF18AQ8NI77 898 aa6.67□□□□□ -1.34
VPS50-220ENST00000544910 E7EWF7 191 aa6.67□□□□□ -1.34
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