RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538923.1

MRE11-208, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, humanhuman

TSL 5

Gene MRE11, Length 558 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11-208ENST00000538923 PPIP5K2O43314 1243 aa11.67□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 LBX1P52954 281 aa11.67□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 SUPT20HQ8NEM7 779 aa11.67□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 BABAM1Q9NWV8 329 aa11.67□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa11.67□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 COL4A5P29400 1685 aa11.67□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 KDM3BQ7LBC6 1761 aa11.67□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 FECHP22830 423 aa11.66□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 ECE1P42892 770 aa11.66□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 AOC3Q16853 763 aa11.66□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.66□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.66□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 TTC13Q8NBP0 860 aa11.66□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 GPRC5DQ9NZD1 345 aa11.66□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 ABCC4O15439 1325 aa11.65□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 HRO43593 1189 aa11.65□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 BBOX1O75936 387 aa11.65□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 RIPK4P57078 832 aa11.65□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.65□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa11.65□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 SLC51AQ86UW1 340 aa11.65□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.65□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 ZNRF3Q9ULT6 936 aa11.65□□□□□ -0.54
MRE11-208ENST00000538923 CST9Q5W186 159 aa11.64□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 CAPNS2Q96L46 248 aa11.64□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 PNMA3Q9UL41 463 aa11.64□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 CDHR2Q9BYE9 1310 aa11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 TRAF5O00463 557 aa11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 CXCL9Q07325 125 aa11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 TNIP1Q15025 636 aa11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 PROSER3Q2NL68 480 aa11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 COPS6Q7L5N1 327 aa11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 NLRP10Q86W26 655 aa11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 SP8Q8IXZ3 490 aa11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 TATDN2Q93075 761 aa11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 LTBP1Q14766 1721 aa11.63□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 SMAPO00193 183 aa11.62□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 ZMYND10O75800 440 aa11.62□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 ANXA1P04083 346 aa11.62□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 KIAA2012Q0VF49 1180 aa11.62□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 GRM1Q13255 1194 aa11.62□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 CYP4F22Q6NT55 531 aa11.62□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 TMC4Q7Z404 712 aa11.62□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 MPNDQ8N594 471 aa11.62□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.62□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 SH3TC1Q8TE82 1336 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 NUP98P52948 1817 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 MAP2K2P36507 400 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 MAP2K5Q13163 448 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 TCIRG1Q13488 830 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 GRAPQ13588 217 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 RALBP1Q15311 655 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 FAM161AQ3B820 660 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 CIAPIN1Q6FI81 312 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 SAPCD2Q86UD0 394 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 NECTIN2Q92692 538 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 ABHD8Q96I13 439 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 HHIPL1Q96JK4 782 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 BCL2L13Q9BXK5 485 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 PGAP2Q9UHJ9 254 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.61□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 GOLGA8CPA6NN73 597 aa11.6□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 C3orf80F5H4A9 247 aa11.6□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 CA12O43570 354 aa11.6□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 RAD17O75943 681 aa11.6□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 CELF2O95319 508 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 SPNS2Q8IVW8 549 aa11.6□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 THSD7BQ9C0I4 1608 aa11.6□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 CDC37L1Q7L3B6 337 aa11.59□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.58□□□□□ -0.55
MRE11-208ENST00000538923 H7C1D1 291 aa11.58□□□□□ -0.56
MRE11-208ENST00000538923 CHL1O00533 1208 aa11.58□□□□□ -0.56
MRE11-208ENST00000538923 AOC2O75106 756 aa11.58□□□□□ -0.56
MRE11-208ENST00000538923 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa11.58□□□□□ -0.56
MRE11-208ENST00000538923 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.58□□□□□ -0.56
MRE11-208ENST00000538923 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.58□□□□□ -0.56
MRE11-208ENST00000538923 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
MRE11-208ENST00000538923 ZNF408Q9H9D4 720 aa11.58□□□□□ -0.56
MRE11-208ENST00000538923 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
MRE11-208ENST00000538923 YDJCA8MPS7 323 aa11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms