RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 ABHD8Q96I13 439 aa30.69■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa30.69■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 CSF1RP07333 972 aa30.68■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 SCARF1Q14162 830 aa30.68■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 MYOZ2Q9NPC6 264 aa30.68■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 LEMD3Q9Y2U8 911 aa30.68■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 ANP32CO43423 234 aa30.67■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 CCDC102AQ96A19 550 aa30.67■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 COA1Q9GZY4 146 aa30.66■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa30.65■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 ITGA6P23229 1130 aa30.65■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 MMP14P50281 582 aa30.65■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 CDCA5Q96FF9 252 aa30.65■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 ZIC5Q96T25 663 aa30.65■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 TSKSQ9UJT2 592 aa30.65■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 MYO3BQ8WXR4 1341 aa30.65■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 DACT2Q5SW24 774 aa30.64■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 STRIP1Q5VSL9 837 aa30.64■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 ANKRD2Q9GZV1 360 aa30.64■■■□□ 2.5
ACER3-211ENST00000531461 FAM161AQ3B820 660 aa30.63■■■□□ 2.49
ACER3-211ENST00000531461 FKBP1BP68106 108 aa30.62■■■□□ 2.49
ACER3-211ENST00000531461 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
ACER3-211ENST00000531461 MPHOSPH8Q99549 860 aa30.62■■■□□ 2.49
ACER3-211ENST00000531461 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa30.61■■■□□ 2.49
ACER3-211ENST00000531461 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
ACER3-211ENST00000531461 TXNRD3Q86VQ6 643 aa30.61■■■□□ 2.49
ACER3-211ENST00000531461 SAGE1Q9NXZ1 904 aa30.61■■■□□ 2.49
ACER3-211ENST00000531461 ZNF804BA4D1E1 1349 aa30.61■■■□□ 2.49
ACER3-211ENST00000531461 AKAP11Q9UKA4 1901 aa30.6■■■□□ 2.49
ACER3-211ENST00000531461 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
ACER3-211ENST00000531461 SLC10A3P09131 477 aa30.59■■■□□ 2.49
ACER3-211ENST00000531461 OGFOD1Q8N543 542 aa30.59■■■□□ 2.49
ACER3-211ENST00000531461 BEND3Q5T5X7 828 aa30.57■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 A0A1B0GUL6 1792 aa30.56■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa30.56■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 CHRNDQ07001 517 aa30.56■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 WNT10BO00744 389 aa30.55■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 FOXO4P98177 505 aa30.55■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 NBPF9Q3BBW0 867 aa30.55■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 TTLL5Q6EMB2 1281 aa30.55■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 MXD3Q9BW11 206 aa30.55■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 IRS2Q9Y4H2 1338 aa30.53■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 KLRK1P26718 216 aa30.53■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 F6X3S4 739 aa30.52■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
ACER3-211ENST00000531461 KCNJ4P48050 445 aa30.51■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 RASAL3Q86YV0 1011 aa30.51■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 FBXW7Q969H0 707 aa30.51■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 CSRNP1Q96S65 589 aa30.51■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 MCOLN1Q9GZU1 580 aa30.51■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 CD209Q9NNX6 404 aa30.51■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 RNF186Q9NXI6 227 aa30.5■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 HDAC9Q9UKV0 1011 aa30.5■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 GRM8O00222 908 aa30.48■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 GTF2IP78347 998 aa30.48■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 CCDC85CA6NKD9 419 aa30.47■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 RGS19P49795 217 aa30.47■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 ALDH1L1O75891 902 aa30.46■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 LMBR1LQ6UX01 489 aa30.46■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 KIAA0825Q8IV33 1275 aa30.46■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 ECM29Q5VYK3 1845 aa30.45■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 TAF5LO75529 589 aa30.45■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 TRPA1O75762 1119 aa30.45■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 IL1R1P14778 569 aa30.45■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 NF2P35240 595 aa30.45■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 DGKZQ13574 1117 aa30.45■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
ACER3-211ENST00000531461 SASH1O94885 1247 aa30.44■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 CCDC57Q2TAC2 916 aa30.44■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 EPHA10Q5JZY3 1008 aa30.44■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 FAM9BQ8IZU0 186 aa30.44■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 CHMP3Q9Y3E7 222 aa30.44■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 ZNF521Q96K83 1311 aa30.44■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 SNAP23O00161 211 aa30.43■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa30.43■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 MOB2Q70IA6 237 aa30.43■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 MTMR14Q8NCE2 650 aa30.43■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 ZNF804AQ7Z570 1209 aa30.42■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 UBE2Q2LH0YL09 131 aa30.41■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa30.41■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 CERS5Q8N5B7 392 aa30.41■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa30.41■■■□□ 2.46
ACER3-211ENST00000531461 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms