RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518930.1

PCM1-209, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 3

Gene PCM1, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-209	ENST00000518930	RAB11FIP3	O75154	756 aa		29.93	■■■□□ 2.38
PCM1-209	ENST00000518930	SASH1	O94885	1247 aa		29.93	■■■□□ 2.38
PCM1-209	ENST00000518930	LPIN2	Q92539	896 aa		29.93	■■■□□ 2.38
PCM1-209	ENST00000518930	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	29.93	■■■□□ 2.38
PCM1-209	ENST00000518930	APBB1	O00213	710 aa		29.92	■■■□□ 2.38
PCM1-209	ENST00000518930	ZNF609	O15014	1411 aa		29.92	■■■□□ 2.38
PCM1-209	ENST00000518930	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	29.91	■■■□□ 2.38
PCM1-209	ENST00000518930	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		29.91	■■■□□ 2.38
PCM1-209	ENST00000518930	COL4A5	P29400	1685 aa		29.91	■■■□□ 2.38
PCM1-209	ENST00000518930	FGFR2	P21802	821 aa		29.9	■■■□□ 2.38
PCM1-209	ENST00000518930	KLRK1	P26718	216 aa		29.9	■■■□□ 2.38
PCM1-209	ENST00000518930	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		29.9	■■■□□ 2.38
PCM1-209	ENST00000518930	DCTPP1	Q9H773	170 aa		29.9	■■■□□ 2.38
PCM1-209	ENST00000518930	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		29.89	■■■□□ 2.38
PCM1-209	ENST00000518930	DOK7	Q18PE1	504 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	GPR108	Q9NPR9	543 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	29.88	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930		A0A1B0GUL7	405 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	TNNI3K	Q59H18	835 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	VPS37D	Q86XT2	251 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	COA1	Q9GZY4	146 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	ECE2	O60344	883 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	GCC1	Q96CN9	775 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	29.85	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	GYG1	P46976	350 aa		29.84	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		29.84	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	TIMM10	P62072	90 aa		29.83	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
PCM1-209	ENST00000518930	FZD9	O00144	591 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	GORAB	Q5T7V8	394 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	PODN	Q7Z5L7	613 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	BCL11A	Q9H165	835 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	PSME4	Q14997	1843 aa		29.81	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	IGHD	P01880	384 aa		29.81	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	AACS	Q86V21	672 aa		29.81	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	XAGE2	Q96GT9	111 aa		29.81	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	CD209	Q9NNX6	404 aa		29.81	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	ADORA1	P30542	326 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	YDJC	A8MPS7	323 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	BCAM	P50895	628 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	29.79	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	SCN9A	Q15858	1988 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	IL1R1	P14778	569 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	TNIP1	Q15025	636 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	FBXW7	Q969H0	707 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
PCM1-209	ENST00000518930	RAD17	O75943	681 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	CCDC102B	Q68D86	513 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	SMC5	Q8IY18	1101 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	PHKA1	P46020	1223 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	USP17L3	A6NCW0	530 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	USP17L4	A6NCW7	530 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	CXCL9	Q07325	125 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	GPC2	Q8N158	579 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	29.72	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	GLTPD2	A6NH11	291 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	PSMD14	O00487	310 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	SEMA3E	O15041	775 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	GTF2I	P78347	998 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	29.7	■■■□□ 2.35
PCM1-209	ENST00000518930	YY1	P25490	414 aa		29.69	■■■□□ 2.34

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