RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489850.5

NOM1-208, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-208ENST00000489850 EPHX2P34913 555 aa25.52■■□□□ 1.68
NOM1-208ENST00000489850 SCNN1DP51172 638 aa25.52■■□□□ 1.68
NOM1-208ENST00000489850 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.52■■□□□ 1.68
NOM1-208ENST00000489850 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.52■■□□□ 1.68
NOM1-208ENST00000489850 PDE8BO95263 885 aa25.51■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.51■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.51■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 KLRK1P26718 216 aa25.5■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 FSTL1Q12841 308 aa25.5■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.5■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 DPF2Q92785 391 aa25.5■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.49■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 USP17L3A6NCW0 530 aa25.49■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 USP17L4A6NCW7 530 aa25.49■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.49■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.49■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 SIL1Q9H173 461 aa25.49■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 SNAP23O00161 211 aa25.48■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.48■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.48■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 ZNF609O15014 1411 aa25.47■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 LDHDQ86WU2 507 aa25.47■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 CD209Q9NNX6 404 aa25.47■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.47■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 EPS15P42566 896 aa25.46■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.46■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.46■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 COG6Q9Y2V7 657 aa25.46■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 SCN9AQ15858 1988 aa25.45■■□□□ 1.67
NOM1-208ENST00000489850 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.45■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 H7C1D1 291 aa25.45■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 ATP8B2P98198 1209 aa25.45■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.45■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.44■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 IL1R1P14778 569 aa25.44■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 VPS37DQ86XT2 251 aa25.44■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 LPIN2Q92539 896 aa25.44■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.44■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 PSME4Q14997 1843 aa25.44■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 SLC5A1P13866 664 aa25.43■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.43■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 CHADLQ6NUI6 762 aa25.43■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 MICALL2Q8IY33 904 aa25.43■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 SSH3Q8TE77 659 aa25.43■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 FGFR2P21802 821 aa25.42■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 MMP14P50281 582 aa25.42■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 POLA2Q14181 598 aa25.42■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 DACT2Q5SW24 774 aa25.42■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 FBXW7Q969H0 707 aa25.42■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.41■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.41■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 GYG1P46976 350 aa25.4■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 GTF2IP78347 998 aa25.4■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.4■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 SASH1O94885 1247 aa25.39■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 USP17L8P0C7I0 530 aa25.39■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 POTEIP0CG38 1075 aa25.39■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 POTEJP0CG39 1038 aa25.39■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 ATP2B3Q16720 1220 aa25.39■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 CEP85Q6P2H3 762 aa25.39■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.39■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 GMLQ99445 158 aa25.39■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.39■■□□□ 1.66
NOM1-208ENST00000489850 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 OGFOD1Q8N543 542 aa25.38■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa25.37■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 HMMRO75330 724 aa25.36■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 HSPA6P17066 643 aa25.36■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.36■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 SHTN1A0MZ66 631 aa25.34■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 BCAMP50895 628 aa25.34■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 TFCP2Q12800 502 aa25.34■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.34■■□□□ 1.65
NOM1-208ENST00000489850 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.7 ms