RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

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Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 ZAP70P43403 619 aa32.38■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 KCNJ4P48050 445 aa32.38■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 MCCP23508 829 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 ANTXR1Q9H6X2 564 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 CRAMP1Q96RY5 1269 aa32.36■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 A0A0D9SFI3 127 aa32.35■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 PI16Q6UXB8 463 aa32.35■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 PDE6BP35913 854 aa32.35■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 BCAMP50895 628 aa32.35■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 KIF2CQ99661 725 aa32.35■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 BBOX1O75936 387 aa32.34■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 CAVIN4Q5BKX8 364 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 AKAP11Q9UKA4 1901 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 BECN1Q14457 450 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA5Q8NB90 893 aa32.32■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
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HOXB3-210ENST00000489475 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 RASGRF1Q13972 1273 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF804BA4D1E1 1349 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
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HOXB3-210ENST00000489475 MED23Q9ULK4 1368 aa32.3■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 SRGNP10124 158 aa32.3■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 NPR1P16066 1061 aa32.3■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 GYG1P46976 350 aa32.3■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa32.29■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 TMC4Q7Z404 712 aa32.29■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP32.29■■■□□ 2.763e-8■■□□□ 14.5
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HOXB3-210ENST00000489475 XDHP47989 1333 aa32.29■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 HELLSQ9NRZ9 838 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC171Q6TFL3 1326 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 CHGBP05060 677 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa32.27■■■□□ 2.76
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HOXB3-210ENST00000489475 ANAPC15P60006 121 aa32.26■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 RABEP1Q15276 862 aa32.26■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa32.26■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 SLC16A10Q8TF71 515 aa32.26■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.76
HOXB3-210ENST00000489475 HSPA4P34932 840 aa32.26■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 PTH1RQ03431 593 aa32.26■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 ALDH1B1P30837 517 aa32.25■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 FBXO33Q7Z6M2 555 aa32.25■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 MASTLQ96GX5 879 aa32.24■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
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HOXB3-210ENST00000489475 GPSM2P81274 684 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 MAP4K1Q92918 833 aa32.22■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 SEMA3EO15041 775 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 SLC4A3P48751 1232 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 WASHC4Q2M389 1173 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 SLFNL1Q499Z3 407 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 SLC51AQ86UW1 340 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 SP8Q8IXZ3 490 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 TBC1D2Q9BYX2 928 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 DENND2AQ9ULE3 1009 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 PALD1Q9ULE6 856 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 C2CD5Q86YS7 1000 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 H0YIN7 160 aa32.2■■■□□ 2.75
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HOXB3-210ENST00000489475 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa32.2■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa32.2■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 APPBP2Q92624 585 aa32.2■■■□□ 2.75
HOXB3-210ENST00000489475 SNX21Q969T3 373 aa32.2■■■□□ 2.75
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HOXB3-210ENST00000489475 PODXL2Q9NZ53 605 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXB3-210ENST00000489475 GGA1Q9UJY5 639 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXB3-210ENST00000489475 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXB3-210ENST00000489475 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
HOXB3-210ENST00000489475 MAST3O60307 1309 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXB3-210ENST00000489475 MYH7P12883 1935 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXB3-210ENST00000489475 ADD2P35612 726 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXB3-210ENST00000489475 HSCBQ8IWL3 235 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXB3-210ENST00000489475 IL17RAQ96F46 866 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXB3-210ENST00000489475 IRS2Q9Y4H2 1338 aa32.18■■■□□ 2.74
HOXB3-210ENST00000489475 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
HOXB3-210ENST00000489475 UFL1O94874 794 aa32.18■■■□□ 2.74
HOXB3-210ENST00000489475 OSBP2Q969R2 916 aa32.18■■■□□ 2.74
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP32.18■■■□□ 2.74
HOXB3-210ENST00000489475 UBE3CQ15386 1083 aa32.17■■■□□ 2.74
HOXB3-210ENST00000489475 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
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