RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		21.79	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	21.79	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		21.79	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	21.78	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	21.78	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		21.78	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	21.77	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		21.77	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	DACT2	Q5SW24	774 aa		21.77	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		21.77	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	21.77	■■□□□ 1.08
HDAC10-216	ENST00000489424	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		21.77	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	21.77	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAF5	O00463	557 aa		21.76	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	21.76	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNJ4	P48050	445 aa		21.76	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	21.76	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		21.76	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		21.76	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	OGFOD1	Q8N543	542 aa		21.76	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SCN9A	Q15858	1988 aa		21.76	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SHTN1	A0MZ66	631 aa		21.75	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP2K2	P36507	400 aa		21.75	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		21.75	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	WBP1L	Q9NX94	342 aa		21.75	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		21.75	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		21.75	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	21.74	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	21.74	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE4A	Q14139	1066 aa		21.74	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		21.74	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		21.74	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		21.74	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	KAZALD1	Q96I82	304 aa		21.74	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		21.74	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		21.74	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	21.73	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	EGFR	P00533	1210 aa		21.73	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	IL1R1	P14778	569 aa		21.73	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	USP48	Q86UV5	1035 aa		21.73	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SULF1	Q8IWU6	871 aa		21.73	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SUCLG2	Q96I99	432 aa		21.73	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CD209	Q9NNX6	404 aa		21.73	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		21.72	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		21.72	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CAPNS2	Q96L46	248 aa		21.72	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	USP44	Q9H0E7	712 aa		21.72	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		21.72	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		21.72	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		21.72	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	SCARF1	Q14162	830 aa		21.71	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	21.71	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	AIDA	Q96BJ3	306 aa		21.71	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	21.71	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		21.71	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		21.71	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	PSME4	Q14997	1843 aa		21.71	■■□□□ 1.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	21.7	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP1B	P68106	108 aa		21.7	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TNS4	Q8IZW8	715 aa		21.7	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		21.7	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		21.7	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	21.69	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	GGA3	Q9NZ52	723 aa		21.69	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO3	Q9UK99	471 aa		21.69	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXN1	O15353	648 aa		21.68	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF5L	O75529	589 aa		21.68	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SASH1	O94885	1247 aa		21.68	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		21.68	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		21.68	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	21.68	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF16B	Q96L93	1317 aa		21.67	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CA12	O43570	354 aa		21.67	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	21.67	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	GTF2I	P78347	998 aa		21.67	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	21.67	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	21.67	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	21.67	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	KLRK1	P26718	216 aa		21.66	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	NOG	Q13253	232 aa		21.66	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	GRM1	Q13255	1194 aa		21.66	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	21.66	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	21.66	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC102A	Q96A19	550 aa		21.66	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		21.65	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	WNT10B	O00744	389 aa		21.65	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CAPN15	O75808	1086 aa		21.65	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		21.65	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		21.65	■■□□□ 1.06
HDAC10-216	ENST00000489424	HUNK	P57058	714 aa		21.64	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	21.64	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		21.64	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	21.64	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		21.63	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	21.63	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE8B	O95263	885 aa		21.63	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	21.63	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	21.63	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CDCA5	Q96FF9	252 aa		21.63	■■□□□ 1.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ADM5	C9JUS6	153 aa		21.62	■■□□□ 1.05

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