RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV5-2P06315 115 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 KBTBD3Q8NAB2 608 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 KDM4AO75164 1064 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 MCM5P33992 734 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 UBE4AQ14139 1066 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 FBXO41Q8TF61 875 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 MMP10P09238 476 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 CHRNDQ07001 517 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC24Q50LG9 513 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRD-211ENST00000486161 ESR2Q92731 530 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRD-211ENST00000486161 JAG2Q9Y219 1238 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRD-211ENST00000486161 TMTC2Q8N394 836 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRD-211ENST00000486161 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
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PTPRD-211ENST00000486161 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.71□□□□□ -0.85
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PTPRD-211ENST00000486161 ATP10DQ9P241 1426 aa9.71□□□□□ -0.85
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PTPRD-211ENST00000486161 PPIP5K2O43314 1243 aa9.71□□□□□ -0.86
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PTPRD-211ENST00000486161 KIF5BP33176 963 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 EIF6P56537 245 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
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PTPRD-211ENST00000486161 MTX1Q13505 466 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 C8orf34Q49A92 452 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC102BQ68D86 513 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 TNS2Q63HR2 1409 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 NPR1P16066 1061 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
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PTPRD-211ENST00000486161 POLA2Q14181 598 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 TTC6Q86TZ1 520 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.7□□□□□ -0.86
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PTPRD-211ENST00000486161 ADCY9O60503 1353 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.7□□□□□ -0.86
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PTPRD-211ENST00000486161 TSPY8P0CW00 308 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 GRAPQ13588 217 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 STK38Q15208 465 aa9.7□□□□□ -0.86
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PTPRD-211ENST00000486161 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
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PTPRD-211ENST00000486161 WTAPQ15007 396 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D9BQ66K14 1250 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 TEX11Q8IYF3 940 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 DDX11Q96FC9 970 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 VEZTQ9HBM0 779 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 SEMA3EO15041 775 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 KRT85P78386 507 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 STX8Q9UNK0 236 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 GYG1P46976 350 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRD-211ENST00000486161 ITPK1Q13572 414 aa9.68□□□□□ -0.86
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