RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TYRO3Q06418 890 aa19.06■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCERG1LQ5VWI1 586 aa19.06■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC171Q6TFL3 1326 aa19.06■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPDC1A2A3K4 754 aa19.06■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP19.06■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNG4Q8TDN1 519 aa19.06■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BAG3O95817 575 aa19.06■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DBNDD2Q9BQY9 259 aa19.06■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa19.06■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ESR2Q92731 530 aa19.06■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F8W031 263 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IQCEQ6IPM2 695 aa19.05■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM227BQ96M60 508 aa19.05■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa19.05■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 YEATS4O95619 227 aa19.05■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAVIN2O95810 425 aa19.05■□□□□ 0.64
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RFC4P35249 363 aa19.05■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP19O94966 1318 aa19.05■□□□□ 0.64
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPTLC2O15270 562 aa19.05■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL2RBP14784 551 aa19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF790Q6PG37 636 aa19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCAF5Q96JK2 942 aa19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BABAM1Q9NWV8 329 aa19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP19.04■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 21.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ROBO2Q9HCK4 1378 aa19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEP135Q66GS9 1140 aa19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 E9PCH4 1651 aa19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSG101Q99816 390 aa19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LUZP1Q86V48 1076 aa19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB9Q96C00 473 aa19.04■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP19.03■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BCORL1Q5H9F3 1711 aa19.03■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT23Q9C075 422 aa19.03■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa19.03■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NLRP3Q96P20 1036 aa19.03■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRERF1Q96PN7 1200 aa19.03■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AATKQ6ZMQ8 1374 aa19.02■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CALML4Q96GE6 196 aa19.02■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM47Q96LD4 638 aa19.02■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGEF10O15013 1369 aa19.02■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA0754O94854 1291 aa19.02■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC40Q4G0X9 1142 aa19.02■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAF1Q8N7H5 531 aa19.02■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LMTK2Q8IWU2 1503 aa19.02■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHMP4BP1P59074 171 aa19.02■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAI1Q9UI46 699 aa19.02■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A2ML1A8K2U0 1454 aa19.01■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDB1Q16531 1140 aa19.01■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAGEB6Q8N7X4 407 aa19.01■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DHX58Q96C10 678 aa19.01■□□□□ 0.63
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RRAGBQ5VZM2 374 aa19.01■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SETDB2Q96T68 719 aa19.01■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTGS1P23219 599 aa19.01■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WWC2Q6AWC2 1192 aa19.01■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.01■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBSNQ9H1K0 784 aa19.01■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GUL7 405 aa19■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO1BO43795 1136 aa19■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPY3P0CV98 308 aa19■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPY8P0CW00 308 aa19■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STX17P56962 302 aa19■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GVL5 298 aa19■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD62A6NC57 917 aa19■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLF2Q8IX21 1173 aa19■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MADDQ8WXG6 1647 aa19■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAFAH1B1P43034 410 aa19■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KANK3Q6NY19 840 aa19■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa19■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP19■□□□□ 0.636e-7■□□□□ 9.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GBP3Q9H0R5 595 aa19■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USO1O60763 962 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LIG1P18858 919 aa18.99■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNNM2Q9H8M5 875 aa18.99■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNX14Q9Y5W7 946 aa18.99■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MACROD2A1Z1Q3 448 aa18.99■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SGSM2O43147 1006 aa18.99■□□□□ 0.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMTC2Q8N394 836 aa18.99■□□□□ 0.63
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