RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476842.1

SMIM4-202, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SMIM4, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-202ENST00000476842 POTECB2RU33 542 aa22.13■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 RAD17O75943 681 aa22.13■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.13■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.13■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 KIF3CO14782 793 aa22.12■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 KLRK1P26718 216 aa22.12■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 CEP85Q6P2H3 762 aa22.12■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.12■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 SPEF2Q9C093 1822 aa22.1■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 FGFR2P21802 821 aa22.1■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 PSMD14O00487 310 aa22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 CD209Q9NNX6 404 aa22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 LPIN2Q92539 896 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-202ENST00000476842 USP17L3A6NCW0 530 aa22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 USP17L4A6NCW7 530 aa22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 IL1R1P14778 569 aa22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 SCNN1DP51172 638 aa22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 HACL1Q9UJ83 578 aa22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 WDR90Q96KV7 1748 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 DPF2Q92785 391 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 SLC5A1P13866 664 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 GYG1P46976 350 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 TFCP2Q12800 502 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 ATP2B3Q16720 1220 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 TOMM70O94826 608 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 SASH1O94885 1247 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 EPS15P42566 896 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 HMMRO75330 724 aa22.03■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 EPHX2P34913 555 aa22.03■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 DACT2Q5SW24 774 aa22.03■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.03■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 BCAMP50895 628 aa22.02■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 GTF2IP78347 998 aa22.02■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 VPS37DQ86XT2 251 aa22.02■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 CRBNQ96SW2 442 aa22.02■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 GMLQ99445 158 aa22.02■■□□□ 1.12
SMIM4-202ENST00000476842 TIMM10P62072 90 aa22.01■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 H7C1D1 291 aa22■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 FBXW7Q969H0 707 aa22■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 GPR108Q9NPR9 543 aa22■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 A0A1B0GUL6 1792 aa21.99■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF609O15014 1411 aa21.99■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.99■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.99■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.99■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 A0A1B0GUL7 405 aa21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 MICALL2Q8IY33 904 aa21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 MXD3Q9BW11 206 aa21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 ZBTB22O15209 634 aa21.97■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.97■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.97■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 SCN9AQ15858 1988 aa21.96■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 SHTN1A0MZ66 631 aa21.96■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 USP17L8P0C7I0 530 aa21.96■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 POTEIP0CG38 1075 aa21.96■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 POTEJP0CG39 1038 aa21.96■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 ADORA1P30542 326 aa21.96■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 MMP14P50281 582 aa21.96■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 C1QTNF8P60827 252 aa21.96■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 AAMPQ13685 434 aa21.96■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
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