RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 FBXO3Q9UK99 471 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF609O15014 1411 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 KLRK1P26718 216 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 PSME4Q14997 1843 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 KCNJ4P48050 445 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 GMLQ99445 158 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 USP17L3A6NCW0 530 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 USP17L4A6NCW7 530 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 EYA2O00167 538 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 PDE8BO95263 885 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 RLBP1P12271 317 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 CD209Q9NNX6 404 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 PLIN1O60240 522 aa20.58■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 GNAI2P04899 355 aa20.58■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 IL1R1P14778 569 aa20.58■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.58■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.58■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 COPRSQ9NQ92 184 aa20.58■□□□□ 0.89
ATG4B-216ENST00000475195 H7C1D1 291 aa20.57■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 CIAO1O76071 339 aa20.57■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 APLP1P51693 650 aa20.57■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 MS4A1P11836 297 aa20.56■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 DACT2Q5SW24 774 aa20.56■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 MICALL2Q8IY33 904 aa20.56■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 PASKQ96RG2 1323 aa20.55■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 SHTN1A0MZ66 631 aa20.55■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 FGFR2P21802 821 aa20.55■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 METTL24Q5JXM2 366 aa20.55■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.55■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.55■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 CEP350Q5VT06 3117 aa20.55■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 MMP14P50281 582 aa20.54■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.54■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 CNTROBQ8N137 903 aa20.54■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 SRGAP3O43295 1099 aa20.53■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 SASH1O94885 1247 aa20.53■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.53■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.53■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.52■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.52■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.52■□□□□ 0.88
ATG4B-216ENST00000475195 EGFRP00533 1210 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 USP17L8P0C7I0 530 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 GTF2IP78347 998 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 ATP8B2P98198 1209 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 PANK1Q8TE04 598 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 GYG1P46976 350 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 POLA2Q14181 598 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 LPIN2Q92539 896 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 MXD3Q9BW11 206 aa20.5■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 SSH3Q8TE77 659 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 SIL1Q9H173 461 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 ZBTB22O15209 634 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 PDE3AQ14432 1141 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 CERS5Q8N5B7 392 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 BCAMP50895 628 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 OGFOD1Q8N543 542 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 CREBZFQ9NS37 354 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-216ENST00000475195 SLC5A1P13866 664 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 HTRA3P83110 453 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 FBXW7Q969H0 707 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms