RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466861.1

SUMO3-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-205	ENST00000466861	ZNF609	O15014	1411 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	RAD17	O75943	681 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	TOMM70	O94826	608 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	HACL1	Q9UJ83	578 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	DPF2	Q92785	391 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	POLA2	Q14181	598 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	SSH3	Q8TE77	659 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	SCNN1D	P51172	638 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	USP17L3	A6NCW0	530 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	USP17L4	A6NCW7	530 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	PSMD14	O00487	310 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	CD209	Q9NNX6	404 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	SNAP23	O00161	211 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	IL1R1	P14778	569 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	FGFR2	P21802	821 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	KLRK1	P26718	216 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	SIL1	Q9H173	461 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	EPHX2	P34913	555 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	CEP85	Q6P2H3	762 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	MMP14	P50281	582 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	LPIN2	Q92539	896 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	SLC5A1	P13866	664 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	FSTL1	Q12841	308 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	28.89	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
SUMO3-205	ENST00000466861	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	C1QTNF8	P60827	252 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861		H7C1D1	291 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	ZBTB22	O15209	634 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	EPS15	P42566	896 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	DACT2	Q5SW24	774 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	LDHD	Q86WU2	507 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	SASH1	O94885	1247 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	ATP2B3	Q16720	1220 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	GML	Q99445	158 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	HMMR	O75330	724 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	VPS37D	Q86XT2	251 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	GYG1	P46976	350 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	GTF2I	P78347	998 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	GPR108	Q9NPR9	543 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SUMO3-205	ENST00000466861	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	MICALL2	Q8IY33	904 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	TFCP2	Q12800	502 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	CHADL	Q6NUI6	762 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	USP17L8	P0C7I0	530 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	AAMP	Q13685	434 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	SEMA3E	O15041	775 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	BCAM	P50895	628 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	OGFOD1	Q8N543	542 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	FBXW7	Q969H0	707 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SUMO3-205	ENST00000466861	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2

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