RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451997.5

SH3BP1-203, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 3,123 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-203ENST00000451997 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP1-203ENST00000451997 AKAP12Q02952 1782 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP1-203ENST00000451997 NEMFO60524 1076 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 SIRT1Q96EB6 747 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 GOLIM4O00461 696 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 ZNF609O15014 1411 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 TIMM10P62072 90 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 CCDC66A2RUB6 948 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 TMEM232C9JQI7 657 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 STK38Q15208 465 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 LINS1Q8NG48 757 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 UBXN4Q92575 508 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 ALDH1L1O75891 902 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 CTAGE5O15320 804 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 PFKFB2O60825 505 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 TAF3Q5VWG9 929 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 COPS6Q7L5N1 327 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 CCDC93Q567U6 631 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 TNNI3KQ59H18 835 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 MNS1Q8NEH6 495 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 AIFM3Q96NN9 605 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 PTPRUQ92729 1446 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 SASH3O75995 380 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 CAVIN2O95810 425 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 KRT32Q14532 448 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 CYP2C19P33261 490 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 FANCCQ00597 558 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 SNRKQ9NRH2 765 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 ZNF202O95125 648 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 RXRAP19793 462 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 GSDMDP57764 484 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 NCAPHQ15003 741 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 CERS3Q8IU89 383 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 PDILTQ8N807 584 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 SMARCE1Q969G3 411 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 E7EWF7 191 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 SERPINC1P01008 464 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 CFAP100Q494V2 611 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 SPECC1Q5M775 1068 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 TEX35Q5T0J7 233 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 KIF28PB7ZC32 967 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 PDIA6Q15084 440 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 WDR24Q96S15 920 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-203ENST00000451997 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-203ENST00000451997 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-203ENST00000451997 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-203ENST00000451997 ATP5JP18859 108 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-203ENST00000451997 EVCP57679 992 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-203ENST00000451997 GCKRQ14397 625 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-203ENST00000451997 KLHL34Q8N239 644 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-203ENST00000451997 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-203ENST00000451997 TECPR2O15040 1411 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms