RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 RNF40O75150 1001 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 ATP5DP30049 168 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC57Q2TAC2 916 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 COG3Q96JB2 828 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 CACNA1FO60840 1977 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7.31□□□□□ -1.24
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SBNO1-202ENST00000420886 RASAL2Q9UJF2 1139 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 HPDP32754 393 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 LRMPQ12912 555 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 TRIM14Q14142 442 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 HOOK3Q86VS8 718 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 ALDH3A1P30838 453 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 KIF1BO60333 1816 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 CROCCP2Q86T23 111 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 C9orf84Q5VXU9 1444 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 ELF1P32519 619 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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SBNO1-202ENST00000420886 NSD3Q9BZ95 1437 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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SBNO1-202ENST00000420886 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 STK26Q9P289 416 aa7.3□□□□□ -1.24
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SBNO1-202ENST00000420886 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 APBA1Q02410 837 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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SBNO1-202ENST00000420886 SPAG1Q07617 926 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 TTC36A6NLP5 189 aa7.3□□□□□ -1.24
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SBNO1-202ENST00000420886 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 SPAG5Q96R06 1193 aa7.3□□□□□ -1.24
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SBNO1-202ENST00000420886 MYH15Q9Y2K3 1946 aa7.29□□□□□ -1.24
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SBNO1-202ENST00000420886 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 CENPKQ9BS16 269 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.29□□□□□ -1.24
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SBNO1-202ENST00000420886 IFT88Q13099 833 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 MTMR3Q13615 1198 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 C8orf74Q6P047 294 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 SELENOSQ9BQE4 189 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 N4BP3O15049 544 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SBNO1-202ENST00000420886 PAK2Q13177 524 aa7.28□□□□□ -1.24
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