RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 CCDC192P0DO97 292 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-202ENST00000420808 ADD1P35611 737 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.54
NISCH-202ENST00000420808 ZAP70P43403 619 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-202ENST00000420808 EVA1CP58658 441 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-202ENST00000420808 CCDC57Q2TAC2 916 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-202ENST00000420808 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-202ENST00000420808 BICD2Q8TD16 824 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-202ENST00000420808 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-202ENST00000420808 TNMDQ9H2S6 317 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-202ENST00000420808 CEP126Q9P2H0 1117 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-202ENST00000420808 TNS2Q63HR2 1409 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-202ENST00000420808 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 MCM5P33992 734 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 ANO6Q4KMQ2 910 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 GPR108Q9NPR9 543 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 TMOD3Q9NYL9 352 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 TPM2P07951 284 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 WASHC4Q2M389 1173 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 GJB4Q9NTQ9 266 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 NWD2Q9ULI1 1742 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 UQCRHLA0A096LP55 91 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 UQCRHP07919 91 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 SLC4A9Q96Q91 983 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 TTC39AQ5SRH9 613 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 GORABQ5T7V8 394 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 CBX8Q9HC52 389 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 PYCARDQ9ULZ3 195 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 CIAO1O76071 339 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 TSC1Q92574 1164 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 USP28Q96RU2 1077 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 ATG3Q9NT62 314 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 FDPSP14324 419 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 DNAJC25Q9H1X3 360 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 GREM2Q9H772 168 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 TAOK2Q9UL54 1235 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 FAM200AQ8TCP9 573 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 AGXT2Q9BYV1 514 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 CLSTN2Q9H4D0 955 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 FGAP02671 866 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 TAF7LQ5H9L4 462 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 SALL1Q9NSC2 1324 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 ABCA3Q99758 1704 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 RIC1Q4ADV7 1423 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 SNAP23O00161 211 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 PIBF1Q8WXW3 757 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 NRBP1Q9UHY1 535 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 MCAMP43121 646 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 CCDC158Q5M9N0 1113 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-202ENST00000420808 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 BTG4Q9NY30 223 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 FAM177BA6PVY3 158 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 FAM13BQ9NYF5 915 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 CSF1RP07333 972 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 PTGS1P23219 599 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 ITGA6P23229 1130 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 ANTXR2P58335 489 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 KIF6Q6ZMV9 814 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 FBXW7Q969H0 707 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 CARMIL3Q8ND23 1372 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 MYH15Q9Y2K3 1946 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 LRMPQ12912 555 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 METTL24Q5JXM2 366 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 NLRP10Q86W26 655 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 TTLL11Q8NHH1 800 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 NBPF3Q9H094 633 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 GPAA1O43292 621 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 ARID3AQ99856 593 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 INCENPQ9NQS7 918 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 RXRAP19793 462 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 ATP2B3Q16720 1220 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 HPS5Q9UPZ3 1129 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-202ENST00000420808 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.2 ms