RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409148.1

LRRTM1-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,126 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-202ENST00000409148 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 ZAP70P43403 619 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 M0R2C6 588 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 PDCP20941 246 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 SCARF1Q14162 830 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 VPS72Q15906 364 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 LAMB2P55268 1798 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 LAMA4Q16363 1823 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 CLCN1P35523 988 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 WASHC4Q2M389 1173 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 OSBP2Q969R2 916 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 Q6ZUG5 572 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 APPBP2Q92624 585 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 PANK2Q9BZ23 570 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 MTMR6Q9Y217 621 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 BCORQ6W2J9 1755 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 NGLY1Q96IV0 654 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 KCNQ2O43526 872 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 MCAMP43121 646 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 USP48Q86UV5 1035 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 LPIN2Q92539 896 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 C8orf37Q96NL8 207 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 FGD1P98174 961 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 TCHHQ07283 1943 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 FAM177BA6PVY3 158 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 GTF3C6Q969F1 213 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 RTL9Q8NET4 1388 aa20.4■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 NTSR2O95665 410 aa20.4■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 HSPA1LP34931 641 aa20.4■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.4■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.4■□□□□ 0.86
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LRRTM1-202ENST00000409148 STK3Q13188 491 aa20.39■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 PI16Q6UXB8 463 aa20.39■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.39■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.39■□□□□ 0.86
LRRTM1-202ENST00000409148 SLC5A1P13866 664 aa20.39■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 FGFR2P21802 821 aa20.39■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 CCDC102BQ68D86 513 aa20.39■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.39■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.38■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 BRF1Q92994 677 aa20.38■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 ATRNO75882 1429 aa20.37■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 ADD2P35612 726 aa20.37■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.37■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 PHKA1P46020 1223 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 GPAA1O43292 621 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.36■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 RGL2O15211 777 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 PFKFB2O60825 505 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 PHF14O94880 888 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 UBE2HP62256 183 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 UBE3CQ15386 1083 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 DTNBO60941 627 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.35■□□□□ 0.85
LRRTM1-202ENST00000409148 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.35■□□□□ 0.85
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