RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407417.7

NFIA-208, Transcript of nuclear factor I A, human

TSL 2 BASIC

Gene NFIA, Length 2,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIA-208	ENST00000407417	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	NUP98	P52948	1817 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	NTSR2	O95665	410 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	TCIRG1	Q13488	830 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	SRGN	P10124	158 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	PSEN1	P49768	467 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	SYNE4	Q8N205	404 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	TTLL6	Q8N841	843 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	NYX	Q9GZU5	481 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	G2E3	Q7L622	706 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	NLRP10	Q86W26	655 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	USP26	Q9BXU7	913 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NFIA-208	ENST00000407417	VAMP4	O75379	141 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	MX1	P20591	662 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	PARP10	Q53GL7	1025 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	LNPK	Q9C0E8	428 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	TNN	Q9UQP3	1299 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	SLC4A2	P04920	1241 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	CUL4A	Q13619	759 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	PKP1	Q13835	747 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	TEX35	Q5T0J7	233 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	MASTL	Q96GX5	879 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	STK31	Q9BXU1	1019 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	C21orf2	O43822	256 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	RASSF7	Q02833	373 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	STYK1	Q6J9G0	422 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	CASC1	Q6TDU7	716 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	NPR1	P16066	1061 aa		10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	ERO1A	Q96HE7	468 aa		10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	MYD88	Q99836	296 aa		10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	ATP8B1	O43520	1251 aa		10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	SLC51A	Q86UW1	340 aa		10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	CNKSR1	Q969H4	720 aa		10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	IL17RA	Q96F46	866 aa		10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		10	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	CHD4	Q14839	1912 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	PRELP	P51888	382 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	CRY2	Q49AN0	593 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	ICE2	Q659A1	982 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	OLFM4	Q6UX06	510 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	FAM89A	Q96GI7	184 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	ADCY9	O60503	1353 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	NFKBIE	O00221	500 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	NEMF	O60524	1076 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	FLII	Q13045	1269 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	GPS2	Q13227	327 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NFIA-208	ENST00000407417	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		9.98	□□□□□ -0.81

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