RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395564.8

UPP1-203, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-203ENST00000395564 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-203ENST00000395564 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-203ENST00000395564 COL4A5P29400 1685 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-203ENST00000395564 FZD9O00144 591 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-203ENST00000395564 SLC5A1P13866 664 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-203ENST00000395564 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
UPP1-203ENST00000395564 ATP2B3Q16720 1220 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-203ENST00000395564 COA1Q9GZY4 146 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-203ENST00000395564 DCTPP1Q9H773 170 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-203ENST00000395564 G3V3G9 751 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-203ENST00000395564 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-203ENST00000395564 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-203ENST00000395564 PODNQ7Z5L7 613 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-203ENST00000395564 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-203ENST00000395564 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-203ENST00000395564 NEFLP07196 543 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 KLRK1P26718 216 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 ECE2O60344 883 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 DOK7Q18PE1 504 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 A0A1B0GUL7 405 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 ZNF609O15014 1411 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 TNNI3KQ59H18 835 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 CD209Q9NNX6 404 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 YDJCA8MPS7 323 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 IL1R1P14778 569 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 TIMM10P62072 90 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 GCC1Q96CN9 775 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 ZBTB22O15209 634 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 GYG1P46976 350 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 VPS37DQ86XT2 251 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 GLTPD2A6NH11 291 aa22.14■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 CXCL9Q07325 125 aa22.14■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 TNIP1Q15025 636 aa22.14■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.14■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 XAGE2Q96GT9 111 aa22.14■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.14■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.14■■□□□ 1.14
UPP1-203ENST00000395564 GPC2Q8N158 579 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 BCAMP50895 628 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 PSME4Q14997 1843 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 USP17L3A6NCW0 530 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 USP17L4A6NCW7 530 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 APBB1O00213 710 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 RAD17O75943 681 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 YY1P25490 414 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 ADORA1P30542 326 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 SCN9AQ15858 1988 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 GORABQ5T7V8 394 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 CCDC102BQ68D86 513 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 SMC5Q8IY18 1101 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 PSMD14O00487 310 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 SEMA3EO15041 775 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 IGHDP01880 384 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 AACSQ86V21 672 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 PHKA1P46020 1223 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
UPP1-203ENST00000395564 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
UPP1-203ENST00000395564 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
UPP1-203ENST00000395564 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
UPP1-203ENST00000395564 GTF2IP78347 998 aa22.08■■□□□ 1.12
UPP1-203ENST00000395564 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
UPP1-203ENST00000395564 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
UPP1-203ENST00000395564 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
UPP1-203ENST00000395564 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.08■■□□□ 1.12
UPP1-203ENST00000395564 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.08■■□□□ 1.12
UPP1-203ENST00000395564 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
UPP1-203ENST00000395564 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-203ENST00000395564 DACT2Q5SW24 774 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-203ENST00000395564 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
UPP1-203ENST00000395564 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-203ENST00000395564 WDR90Q96KV7 1748 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms