RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L3A6NCW0 530 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L4A6NCW7 530 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 COA1Q9GZY4 146 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 SNAP23O00161 211 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 DLK2Q6UY11 383 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP44Q9H0E7 712 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 G3V3G9 751 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 TAF5LO75529 589 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 TNS4Q8IZW8 715 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 MXD3Q9BW11 206 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP48Q86UV5 1035 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 CD209Q9NNX6 404 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP17L8P0C7I0 530 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 WBP1LQ9NX94 342 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 GGA3Q9NZ52 723 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADM5C9JUS6 153 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 IL1R1P14778 569 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 MIER1Q8N108 512 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 CAPNS2Q96L46 248 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 FOXN1O15353 648 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 CERS5Q8N5B7 392 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 MMP14P50281 582 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 SCARF1Q14162 830 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 KCNJ4P48050 445 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 UBE4AQ14139 1066 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 GTF2IP78347 998 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 WNT10BO00744 389 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 CAPN15O75808 1086 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 ECE1P42892 770 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 LRRC24Q50LG9 513 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 CDCA5Q96FF9 252 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 SULF1Q8IWU6 871 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 AOC2O75106 756 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAP2K2P36507 400 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIF16BQ96L93 1317 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLIN1O60240 522 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms