RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 MAP10Q9P2G4 905 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 USP25Q9UHP3 1055 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF853P0CG23 659 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 RETREG3Q86VR2 466 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 NBPF4Q96M43 638 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 ZBBXA8MT70 800 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 FAM193AP78312 1265 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 SDSP20132 328 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 NCOA4Q13772 614 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 TMX3Q96JJ7 454 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 RGS12O14924 1447 aa8.57□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 GNAT3A8MTJ3 354 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 LGR5O75473 907 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 NEK4P51957 841 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 MORN1Q5T089 497 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 LYPD8Q6UX82 237 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 ATP10DQ9P241 1426 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 MAP3K5Q99683 1374 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L15C9J2P7 530 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L10C9JJH3 530 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L12C9JPN9 530 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L11C9JVI0 530 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L21D6R901 530 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L18D6R9N7 530 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L22D6RA61 530 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L19D6RCP7 530 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L20D6RJB6 530 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 MX1P20591 662 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 RASA1P20936 1047 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2HP62256 183 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L24Q0WX57 530 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 PIP4K2BP78356 416 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 CHRNA2Q15822 529 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 BABAM1Q9NWV8 329 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 AOX1Q06278 1338 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 PKP1Q13835 747 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 AKAP4Q5JQC9 854 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 CEP85Q6P2H3 762 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 RNF214Q8ND24 703 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 SPG7Q9UQ90 795 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC37A3O60309 1634 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 EVA1CP58658 441 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 PTK7Q13308 1070 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf141Q5JVX7 400 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 MBIPQ9NS73 344 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 ADCY5O95622 1261 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 CCT4P50991 539 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 OGFRQ9NZT2 677 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 PKD1L3Q7Z443 1732 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 JCADQ9P266 1359 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 CTIFO43310 598 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 CAVIN2O95810 425 aa8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CTPS1-201ENST00000372616 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa8.53□□□□□ -1.04
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