RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
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LTV1-201ENST00000367576 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
LTV1-201ENST00000367576 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.61■■□□□ 1.05
LTV1-201ENST00000367576 CHMLP26374 656 aa21.6■■□□□ 1.05
LTV1-201ENST00000367576 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.6■■□□□ 1.05
LTV1-201ENST00000367576 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
LTV1-201ENST00000367576 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.6■■□□□ 1.05
LTV1-201ENST00000367576 XDHP47989 1333 aa21.6■■□□□ 1.05
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LTV1-201ENST00000367576 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
LTV1-201ENST00000367576 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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LTV1-201ENST00000367576 STYK1Q6J9G0 422 aa21.59■■□□□ 1.05
LTV1-201ENST00000367576 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.59■■□□□ 1.05
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LTV1-201ENST00000367576 UFL1O94874 794 aa21.58■■□□□ 1.05
LTV1-201ENST00000367576 KLHL34Q8N239 644 aa21.58■■□□□ 1.05
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LTV1-201ENST00000367576 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.57■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 RASGRF1Q13972 1273 aa21.57■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 TMC4Q7Z404 712 aa21.57■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.57■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 SP8Q8IXZ3 490 aa21.57■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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LTV1-201ENST00000367576 VPS37DQ86XT2 251 aa21.56■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 GGA1Q9UJY5 639 aa21.56■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 DPEP1P16444 411 aa21.55■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.55■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.55■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 IL25Q9H293 177 aa21.55■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.55■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.55■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.55■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 SLX4Q8IY92 1834 aa21.54■■□□□ 1.04
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LTV1-201ENST00000367576 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.54■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 SPATA5Q8NB90 893 aa21.54■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 CNKSR1Q969H4 720 aa21.54■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 LTBP1Q14766 1721 aa21.54■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.53■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.53■■□□□ 1.04
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LTV1-201ENST00000367576 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.52■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.52■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 PTGER2P43116 358 aa21.52■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.52■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 MPNDQ8N594 471 aa21.52■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.52■■□□□ 1.04
LTV1-201ENST00000367576 A0A0D9SFI3 127 aa21.51■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.5■■□□□ 1.03
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LTV1-201ENST00000367576 HIP1O00291 1037 aa21.49■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 RIMBP2O15034 1052 aa21.49■■□□□ 1.03
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LTV1-201ENST00000367576 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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LTV1-201ENST00000367576 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.49■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.49■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 SGSM2O43147 1006 aa21.48■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 C21orf2O43822 256 aa21.48■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.48■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.48■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.48■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 REC8O95072 547 aa21.47■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.47■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 MED23Q9ULK4 1368 aa21.47■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.46■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.46■■□□□ 1.03
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