RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 C4orf48Q5BLP8 95 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 XKR5Q6UX68 686 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 CAMKK2Q96RR4 588 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC25Q9H1X3 360 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ARNT2Q9HBZ2 717 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 CLSPNQ9HAW4 1339 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 CD109Q6YHK3 1445 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 A0A087X0B3 334 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 DXOO77932 396 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf53Q5VUE5 145 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF454Q8N9F8 522 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SHDQ96IW2 340 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 RHOVQ96L33 236 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 MTA3Q9BTC8 594 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 RSRP1Q9BUV0 290 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 COPRSQ9NQ92 184 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 RAPGEF3O95398 923 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 MCL1Q07820 350 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 MSS51Q4VC12 460 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 JAMLQ86YT9 394 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 GLIS3Q8NEA6 775 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 V9GY48 417 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ATP10BO94823 1461 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 MBD5Q9P267 1494 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRB3O60242 1522 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SHANK2Q9UPX8 1470 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PRU2 124 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ESYT3A0FGR9 886 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 OPLAHO14841 1288 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 TSPAN6O43657 245 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 STK10O94804 968 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PMLP29590 882 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ANAPC15P60006 121 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PTK2Q05397 1052 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PSMD2Q13200 908 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 LYSTQ99698 3801 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 RGPD1P0DJD0 1748 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ATP7AQ04656 1500 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 GOLGA8CPA6NN73 597 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 C6orf229H3BNL8 230 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 RNF180Q86T96 592 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 RDH13Q8NBN7 331 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PGAP2Q9UHJ9 254 aa3.34□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CTC1Q2NKJ3 1217 aa3.34□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 RNF20Q5VTR2 975 aa3.34□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 NXNQ6DKJ4 435 aa3.34□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CYLDQ9NQC7 956 aa3.34□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 POGZQ7Z3K3 1410 aa3.34□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 GIPC1O14908 333 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFB5O43674 189 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 SRGNP10124 158 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 CTHP32929 405 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ITGAEP38570 1179 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 ADAM32Q8TC27 787 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 C2orf27AQ580R0 203 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 C16orf46Q6P387 395 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 DEPDC7Q96QD5 511 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 STIM2Q9P246 746 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 VTI1BQ9UEU0 232 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 DOLKQ9UPQ8 538 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 BRWD3Q6RI45 1802 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 RFPL3O75679 317 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 PDGFAP04085 211 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 WNT7BP56706 349 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 RASGRF1Q13972 1273 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 MORC3Q14149 939 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 JDP2Q8WYK2 163 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 NT5C1AQ9BXI3 368 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 JADE2Q9NQC1 790 aa3.33□□□□□ -1.88
CCSAP-202ENST00000366686 IGF1RP08069 1367 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms