RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 GOLGA6CA6NDK9 693 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 GOLGA6DP0CG33 693 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 PODNQ7Z5L7 613 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 F13A1P00488 732 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 GUCY1B3Q02153 619 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 CUL5Q93034 780 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 RHOXF2BP0C7M4 288 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 NOP2P46087 812 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 CATIPQ7Z7H3 387 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 SPAG5Q96R06 1193 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 NPHP3Q7Z494 1330 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 INSRP06213 1382 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 DEUP1Q05D60 604 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 DACT1Q9NYF0 836 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF76P36508 570 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 CHMP4BP1P59074 171 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 IFT20Q8IY31 132 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 PARP2Q9UGN5 583 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 ISM2Q6H9L7 571 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 APBA1Q02410 837 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 NEDD9Q14511 834 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 AIDAQ96BJ3 306 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 EXOC1Q9NV70 894 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 MPHOSPH8Q99549 860 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 PSMA7O14818 248 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 PCK1P35558 622 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 MGEA5O60502 916 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 BRAPQ7Z569 592 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 CAPZA3Q96KX2 299 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP8B1O43520 1251 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC12A7Q9Y666 1083 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 NESP48681 1621 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 CERS3Q8IU89 383 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 SEC24BO95487 1268 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 GAS8O95995 478 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 DRC3Q9H069 523 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 CNNM2Q9H8M5 875 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 AKR1B10O60218 316 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 RLBP1P12271 317 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 ATF3P18847 181 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGAP45Q92619 1136 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 MYL6BP14649 208 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 ODF2LQ9ULJ1 636 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 FCHSD1Q86WN1 690 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 CALCOCO2Q13137 446 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 BRD3Q15059 726 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP2-201ENST00000356331 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 ERCC3P19447 782 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 CEP126Q9P2H0 1117 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 SNX16P57768 344 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 SMC1BQ8NDV3 1235 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 JPH4Q96JJ6 628 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 NSD3Q9BZ95 1437 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 SYKP43405 635 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 EFCAB13Q8IY85 973 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 GOLGA8BA8MQT2 603 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 SELENOSQ9BQE4 189 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 GBP5Q96PP8 586 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 TXNDC16Q9P2K2 825 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 NEK11Q8NG66 645 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP2-201ENST00000356331 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms