RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 GNPATO15228 680 aa20.3■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 ANKRD1Q15327 319 aa20.3■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.3■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 C4BP0C0L5 1744 aa20.29■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.29■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 PKP1Q13835 747 aa20.29■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 LPIN2Q92539 896 aa20.29■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.29■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 CHGBP05060 677 aa20.29■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 RPS6KB1P23443 525 aa20.29■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 BAG6P46379 1132 aa20.29■□□□□ 0.84
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SSR4-201ENST00000320857 BRD1O95696 1058 aa20.28■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 SLC5A1P13866 664 aa20.28■□□□□ 0.84
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SSR4-201ENST00000320857 SCARF1Q14162 830 aa20.27■□□□□ 0.84
SSR4-201ENST00000320857 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
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SSR4-201ENST00000320857 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.26■□□□□ 0.83
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SSR4-201ENST00000320857 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SSR4-201ENST00000320857 NEK1Q96PY6 1258 aa20.26■□□□□ 0.83
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SSR4-201ENST00000320857 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.26■□□□□ 0.83
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SSR4-201ENST00000320857 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.25■□□□□ 0.83
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SSR4-201ENST00000320857 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.22■□□□□ 0.83
SSR4-201ENST00000320857 PROM2Q8N271 834 aa20.22■□□□□ 0.83
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SSR4-201ENST00000320857 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.22■□□□□ 0.83
SSR4-201ENST00000320857 ADRA2BP18089 450 aa20.22■□□□□ 0.83
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SSR4-201ENST00000320857 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SSR4-201ENST00000320857 GJB2P29033 226 aa20.18■□□□□ 0.82
SSR4-201ENST00000320857 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SSR4-201ENST00000320857 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.18■□□□□ 0.82
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