RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315423.11

TNIP2-201, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIP2, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2-201ENST00000315423 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP29.76■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 GREM2Q9H772 168 aa29.76■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 M0R2C6 588 aa29.75■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 PDE8AO60658 829 aa29.75■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 PFKFB2O60825 505 aa29.75■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 METTL24Q5JXM2 366 aa29.75■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa29.75■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 STK3Q13188 491 aa29.75■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 SLFNL1Q499Z3 407 aa29.75■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.75■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 FBXL16Q8N461 479 aa29.75■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 OSBP2Q969R2 916 aa29.75■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 CTNNA3Q9UI47 895 aa29.75■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 E7EWF7 191 aa29.74■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 VGLL2Q8N8G2 317 aa29.74■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 BRF1Q92994 677 aa29.74■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.74■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 SYNE4Q8N205 404 aa29.73■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa29.73■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 APPBP2Q92624 585 aa29.73■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 MYH15Q9Y2K3 1946 aa29.73■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 LAMB2P55268 1798 aa29.73■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 CHMP4CQ96CF2 233 aa29.73■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 ATRNO75882 1429 aa29.72■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 FGD1P98174 961 aa29.72■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 SCARF1Q14162 830 aa29.72■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 UBN2Q6ZU65 1347 aa29.71■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 CNNM1Q9NRU3 951 aa29.71■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 DTNBO60941 627 aa29.7■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 ZAP70P43403 619 aa29.7■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 EIF5P55010 431 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 SLIT2O94813 1529 aa29.7■■■□□ 2.35
TNIP2-201ENST00000315423 SCRN1Q12765 414 aa29.7■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 UVSSAQ2YD98 709 aa29.7■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa29.7■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP29.7■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 JAK2O60674 1132 aa29.69■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 ADAMTS2O95450 1211 aa29.69■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 DDB1Q16531 1140 aa29.69■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 ZSCAN30Q86W11 494 aa29.69■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 KIF3AQ9Y496 699 aa29.69■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 TTC6Q86TZ1 520 aa29.68■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 PDE8BO95263 885 aa29.68■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 WASHC4Q2M389 1173 aa29.68■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 FERMT3Q86UX7 667 aa29.68■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 FBXO41Q8TF61 875 aa29.68■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 CCDC87Q9NVE4 849 aa29.68■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 ZNF831Q5JPB2 1677 aa29.67■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 FOXP2O15409 715 aa29.67■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 MCAMP43121 646 aa29.67■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa29.67■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 EVCP57679 992 aa29.66■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 LRRC2Q9BYS8 371 aa29.66■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 MROH5Q6ZUA9 1318 aa29.66■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 RESTQ13127 1097 aa29.66■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 DOCK2Q92608 1830 aa29.65■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 RNF214Q8ND24 703 aa29.65■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 APOBRQ0VD83 1088 aa29.64■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa29.64■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 SALL1Q9NSC2 1324 aa29.64■■■□□ 2.34
TNIP2-201ENST00000315423 BCORQ6W2J9 1755 aa29.64■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 A0A0G2JLW4 131 aa29.63■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 WDR19Q8NEZ3 1342 aa29.63■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 FUCA2Q9BTY2 467 aa29.63■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 ADD2P35612 726 aa29.63■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 PARP10Q53GL7 1025 aa29.63■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 TTLL5Q6EMB2 1281 aa29.63■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 RTL9Q8NET4 1388 aa29.62■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.62■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.62■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 H3BQV1 296 aa29.62■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 GPAA1O43292 621 aa29.62■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 IFFO2Q5TF58 517 aa29.62■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 PI16Q6UXB8 463 aa29.62■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 LPIN2Q92539 896 aa29.62■■■□□ 2.33
TNIP2-201ENST00000315423 SPATA32Q96LK8 384 aa29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.3 ms