RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 PARP10Q53GL7 1025 aa23.33■■□□□ 1.33
LRIG1-201ENST00000273261 BRAPQ7Z569 592 aa23.33■■□□□ 1.33
LRIG1-201ENST00000273261 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa23.33■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 G2E3Q7L622 706 aa23.33■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.32■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 EYA2O00167 538 aa23.32■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 SSR1P43307 286 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.32■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 FAM193AP78312 1265 aa23.32■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 EHBP1Q8NDI1 1231 aa23.32■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM75PA6NK02 468 aa23.31■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 DACT1Q9NYF0 836 aa23.31■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.31■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 SPTLC2O15270 562 aa23.31■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM47Q96LD4 638 aa23.31■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 N4BP3O15049 544 aa23.3■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 STAT6P42226 847 aa23.3■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 LUZP1Q86V48 1076 aa23.3■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 PPFIA3O75145 1194 aa23.3■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 SCLT1Q96NL6 688 aa23.3■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 ANO6Q4KMQ2 910 aa23.29■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.29■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.29■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 C6orf50Q9HD87 102 aa23.29■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.29■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.29■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 UBASH3AP57075 661 aa23.28■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.28■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.28■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 C8orf37Q96NL8 207 aa23.28■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.28■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.28■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.27■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.27■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 MBD5Q9P267 1494 aa23.27■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 TNNI3KQ59H18 835 aa23.27■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 TAX1BP1Q86VP1 789 aa23.27■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.27■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.27■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 RTL1A6NKG5 1358 aa23.27■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
LRIG1-201ENST00000273261 NAPAP54920 295 aa23.26■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC172P0C7W6 258 aa23.26■■□□□ 1.31
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LRIG1-201ENST00000273261 APOBRQ0VD83 1088 aa23.26■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.26■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 PSMA7O14818 248 aa23.26■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 TUBB4AP04350 444 aa23.26■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.26■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 OGFOD1Q8N543 542 aa23.25■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 BTG4Q9NY30 223 aa23.25■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.25■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 USP19O94966 1318 aa23.25■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 KRT2P35908 639 aa23.25■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.25■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 ISM2Q6H9L7 571 aa23.24■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 A0A1B0GUL7 405 aa23.24■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 EYA3Q99504 573 aa23.24■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.24■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 ORAI2Q96SN7 254 aa23.23■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 PDE8AO60658 829 aa23.23■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 NEBLO76041 1014 aa23.23■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 EZRP15311 586 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 RPS6KB1P23443 525 aa23.23■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 AFMP43652 599 aa23.23■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 TMEM87BQ96K49 555 aa23.23■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.22■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 GNA11P29992 359 aa23.22■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 USP37Q86T82 979 aa23.22■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 SAMM50Q9Y512 469 aa23.22■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 WDR78Q5VTH9 848 aa23.22■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 CEP135Q66GS9 1140 aa23.22■■□□□ 1.31
LRIG1-201ENST00000273261 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
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