RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 DLK2Q6UY11 383 aa26.43■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.42■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.42■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 PODNQ7Z5L7 613 aa26.42■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 SAPCD2Q86UD0 394 aa26.42■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.42■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 ECE1P42892 770 aa26.41■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 KCNJ4P48050 445 aa26.41■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 CDC37L1Q7L3B6 337 aa26.4■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.39■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 MED23Q9ULK4 1368 aa26.39■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 USP17L3A6NCW0 530 aa26.39■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 USP17L4A6NCW7 530 aa26.39■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 EGFRP00533 1210 aa26.39■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.39■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.39■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.39■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 FBXW7Q969H0 707 aa26.39■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 SUCLG2Q96I99 432 aa26.39■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 TSKSQ9UJT2 592 aa26.39■■□□□ 1.82
CITED1-201ENST00000246139 SPEF2Q9C093 1822 aa26.39■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 CHRNDQ07001 517 aa26.38■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.38■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.38■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 SCN9AQ15858 1988 aa26.38■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 UTYO14607 1347 aa26.38■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 USP48Q86UV5 1035 aa26.37■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.36■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 ABHD8Q96I13 439 aa26.36■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 COA1Q9GZY4 146 aa26.36■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 MAP2K2P36507 400 aa26.35■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.35■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 KAZALD1Q96I82 304 aa26.35■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 TAF5LO75529 589 aa26.34■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 USP17L8P0C7I0 530 aa26.34■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 KRT26Q7Z3Y9 468 aa26.34■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 ZIC5Q96T25 663 aa26.34■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 KLRK1P26718 216 aa26.33■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.33■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.33■■□□□ 1.81
CITED1-201ENST00000246139 PLIN1O60240 522 aa26.32■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 HHIPL1Q96JK4 782 aa26.32■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 BEGAINQ9BUH8 593 aa26.32■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa26.31■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 SNAP23O00161 211 aa26.31■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 GMLQ99445 158 aa26.31■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 MXD3Q9BW11 206 aa26.31■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 USP44Q9H0E7 712 aa26.31■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 DACT2Q5SW24 774 aa26.3■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.3■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.3■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 SCARF1Q14162 830 aa26.29■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.29■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 SULF1Q8IWU6 871 aa26.29■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 OGFOD1Q8N543 542 aa26.29■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 GGA3Q9NZ52 723 aa26.29■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 ADM5C9JUS6 153 aa26.28■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.28■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 GTF2IP78347 998 aa26.27■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 CD209Q9NNX6 404 aa26.27■■□□□ 1.8
CITED1-201ENST00000246139 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.26■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 HUNKP57058 714 aa26.26■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 ZNF609O15014 1411 aa26.25■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 KIF16BQ96L93 1317 aa26.25■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.25■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.24■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 C2orf69Q8N8R5 385 aa26.23■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 PSME4Q14997 1843 aa26.23■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.22■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.22■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.22■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.21■■□□□ 1.79
CITED1-201ENST00000246139 CCDC85CA6NKD9 419 aa26.2■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 CA12O43570 354 aa26.2■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 BCAR3O75815 825 aa26.2■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 NOGQ13253 232 aa26.2■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.2■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms