RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
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ODC1-201ENST00000234111 Q6ZUG5 572 aa24.61■■□□□ 1.53
ODC1-201ENST00000234111 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.61■■□□□ 1.53
ODC1-201ENST00000234111 BPIFA3Q9BQP9 254 aa24.61■■□□□ 1.53
ODC1-201ENST00000234111 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.61■■□□□ 1.53
ODC1-201ENST00000234111 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
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ODC1-201ENST00000234111 PPFIA3O75145 1194 aa24.6■■□□□ 1.53
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ODC1-201ENST00000234111 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.6■■□□□ 1.53
ODC1-201ENST00000234111 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.6■■□□□ 1.53
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ODC1-201ENST00000234111 FSD1Q9BTV5 496 aa24.59■■□□□ 1.53
ODC1-201ENST00000234111 SNRKQ9NRH2 765 aa24.59■■□□□ 1.53
ODC1-201ENST00000234111 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.59■■□□□ 1.53
ODC1-201ENST00000234111 GUCY1B3Q02153 619 aa24.59■■□□□ 1.53
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ODC1-201ENST00000234111 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.58■■□□□ 1.53
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ODC1-201ENST00000234111 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
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ODC1-201ENST00000234111 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.58■■□□□ 1.53
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ODC1-201ENST00000234111 ZSCAN12O43309 604 aa24.58■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 NEK1Q96PY6 1258 aa24.58■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
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ODC1-201ENST00000234111 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.57■■□□□ 1.52
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ODC1-201ENST00000234111 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.57■■□□□ 1.52
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ODC1-201ENST00000234111 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
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ODC1-201ENST00000234111 DHX58Q96C10 678 aa24.56■■□□□ 1.52
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ODC1-201ENST00000234111 HSD3B7Q9H2F3 369 aa24.55■■□□□ 1.52
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ODC1-201ENST00000234111 UBASH3AP57075 661 aa24.55■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 NLRP12P59046 1061 aa24.55■■□□□ 1.52
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ODC1-201ENST00000234111 MYH15Q9Y2K3 1946 aa24.55■■□□□ 1.52
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ODC1-201ENST00000234111 CTDNEP1O95476 244 aa24.54■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.54■■□□□ 1.52
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ODC1-201ENST00000234111 TAF5LO75529 589 aa24.54■■□□□ 1.52
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ODC1-201ENST00000234111 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 ADALQ6DHV7 355 aa24.53■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 TMEM139Q8IV31 216 aa24.53■■□□□ 1.52
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ODC1-201ENST00000234111 TMEM232C9JQI7 657 aa24.53■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 SERPINC1P01008 464 aa24.53■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 KRT32Q14532 448 aa24.53■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 FCHSD1Q86WN1 690 aa24.53■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.53■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 CACNA1FO60840 1977 aa24.53■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 BRD3Q15059 726 aa24.52■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.52■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 ARHGAP6O43182 974 aa24.52■■□□□ 1.52
ODC1-201ENST00000234111 ATP2B1P20020 1258 aa24.52■■□□□ 1.52
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