RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171735.1

Nisch-221, Transcript of Nischarin, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 1,763 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-221ENSMUST00000171735 Bcar3Q9QZK2 820 aa20.36■□□□□ 0.85
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cyp2c68K7N6C2 491 aa20.35■□□□□ 0.85
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mre11Q61216 706 aa20.35■□□□□ 0.85
Nisch-221ENSMUST00000171735 WdpcpQ8C456 722 aa20.35■□□□□ 0.85
Nisch-221ENSMUST00000171735 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa20.35■□□□□ 0.85
Nisch-221ENSMUST00000171735 Myh4Q5SX39 1939 aa20.34■□□□□ 0.85
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zbtb45Q52KG4 520 aa20.34■□□□□ 0.85
Nisch-221ENSMUST00000171735 Plekhg6Q8R0J1 787 aa20.34■□□□□ 0.85
Nisch-221ENSMUST00000171735 Setdb1O88974 1307 aa20.34■□□□□ 0.85
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa20.34■□□□□ 0.85
Nisch-221ENSMUST00000171735 Taf5lQ91WQ5 589 aa20.34■□□□□ 0.85
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fam84aQ9D650 292 aa20.34■□□□□ 0.85
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kcna3P16390 528 aa20.33■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Csrnp1P59054 583 aa20.33■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nlrp9aQ66X03 949 aa20.33■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fchsd1Q6PFY1 688 aa20.33■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ankrd63A2ARS0 390 aa20.32■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krt25Q8VCW2 446 aa20.32■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Riok1Q922Q2 567 aa20.32■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sptbn5F6UCX4 1208 aa20.31■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Map3k9Q3U1V8 1077 aa20.31■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gpr162Q3UN16 588 aa20.31■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Abtb2Q7TQI7 1024 aa20.31■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sept9Q80UG5 583 aa20.31■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gjd4Q8BSD4 364 aa20.31■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm5592Q3V0A6 857 aa20.3■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Vps54Q5SPW0 977 aa20.3■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Erc2Q6PH08 957 aa20.3■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fam160b2Q80YR2 744 aa20.3■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Arfgef1G3X9K3 1846 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rbbp6P97868 1790 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Izumo3A6PWV3 263 aa20.29■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Vil1Q62468 827 aa20.29■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 TnksQ6PFX9 1320 aa20.29■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa20.29■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 A0A1W2P7S8 802 aa20.29■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Prl3d1P18121 224 aa20.29■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cdc5lQ6A068 802 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 CenppQ9CZ92 286 aa20.29■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa20.28■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mast3Q3U214 1321 aa20.27■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Terf1P70371 421 aa20.27■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 ZyxQ62523 564 aa20.27■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Letm1Q9Z2I0 738 aa20.27■□□□□ 0.84
Nisch-221ENSMUST00000171735 Eddm13E9Q7F5 164 aa20.26■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zkscan2G3X952 960 aa20.26■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Hmox1P14901 289 aa20.26■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Spg7Q3ULF4 781 aa20.26■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Megf6Q80V70 1572 aa20.26■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Usp17lbE9Q9U0 468 aa20.26■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rnf180Q3U827 592 aa20.26■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa20.26■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa20.26■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pram1Q6BCL1 675 aa20.26■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa20.25■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 CfhP06909 1234 aa20.25■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 XpcP51612 930 aa20.25■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nell2Q61220 819 aa20.25■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Glis3Q6XP49 780 aa20.25■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Znf428Q8C1M2 176 aa20.25■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trmt44Q9D2Q2 713 aa20.25■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ube3bQ9ES34 1070 aa20.25■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Myh3P13541 1940 aa20.24■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa20.24■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 AaasP58742 546 aa20.24■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fam83bQ0VBM2 1012 aa20.24■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rdm1Q9CQK3 281 aa20.24■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa20.24■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa20.24■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Psme4Q5SSW2 1843 aa20.24■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kifc2O08672 792 aa20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mapkapk5O54992 473 aa20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Slc7a3P70423 618 aa20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 CbarpQ66L44 698 aa20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rhot2Q8JZN7 620 aa20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ly6iQ9WU67 134 aa20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nek4Q9Z1J2 792 aa20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Myh13B1AR69 1938 aa20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Prl7d1P04769 244 aa20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nme8Q715T0 586 aa20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Znf18Q810A1 556 aa20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Golim4Q8BXA1 655 aa20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Brf1Q8CFK2 676 aa20.23■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10093D3YYI8 482 aa20.22■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 NogP97466 232 aa20.22■□□□□ 0.83
Nisch-221ENSMUST00000171735 Psmd1Q3TXS7 953 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.6 ms