RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025279.5

Npc1-201, Transcript of Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Npc1, Length 5,224 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1-201ENSMUST00000025279 Ccdc25Q78PG9 208 aa14.64□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Ccdc186Q8C9S4 917 aa14.64□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Trak2Q6P9N8 913 aa14.64□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Usp11Q99K46 921 aa14.64□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Fam135bQ9DAI6 1403 aa14.64□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa14.64□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Map7d1A2AJI0 846 aa14.64□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Gm1993A6X8I0 212 aa14.64□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 SlxD3Z347 212 aa14.64□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Fam213aQ9CYH2 218 aa14.64□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Sept7O55131 436 aa14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Chmp6P0C0A3 200 aa14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Tcerg1lQ3B807 590 aa14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Cplx4Q80WM3 160 aa14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Taok3Q8BYC6 898 aa14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Cnpy2Q9QXT0 182 aa14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Gas2l2Q5SSG4 860 aa14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 HellsQ60848 821 aa14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Abtb2Q7TQI7 1024 aa14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Mxra7Q9CZH7 178 aa14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Ccdc105Q9D4K7 499 aa14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Epb41l3Q9WV92 929 aa14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Sdad1Q80UZ2 687 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Syce1Q9D495 329 aa14.63□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Zscan25B2RX31 543 aa14.62□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Samd15F6XZJ7 620 aa14.62□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Fbln2P37889 1221 aa14.62□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Terf1P70371 421 aa14.62□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Ubash3aQ3V3E1 624 aa14.62□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Jarid2Q62315 1234 aa14.62□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Sept6Q9R1T4 434 aa14.62□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Nek5Q7TSC3 627 aa14.62□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Uba5Q8VE47 403 aa14.62□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Six6os1Q9CTN5 574 aa14.62□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Golga5Q9QYE6 729 aa14.62□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Letm1Q9Z2I0 738 aa14.62□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Tekt3Q6X6Z7 490 aa14.62□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Lztfl1Q9JHQ5 299 aa14.62□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 MycbpapQ5SUV2 932 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Tsr2Q8C8T8 191 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Slx4Q6P1D7 1565 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Ppp1r9aH3BJD6 1292 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 P4ha1Q60715 534 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Mkrn1Q9QXP6 481 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Eftud2O08810 971 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Pex1Q5BL07 1284 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Gbp7Q91Z40 638 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Capn12Q9ER56 720 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Tldc2A2ACG1 198 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Eef2P58252 858 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Bach2P97303 839 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Jade3Q6IE82 823 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Mlh1Q9JK91 760 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Atp10dQ8K2X1 1416 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Naip7Q9JIB3 1402 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Naip6Q9JIB6 1403 aa14.61□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Crocc2F6XLV1 1638 aa14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 SsbP32067 415 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Tex35Q14BK3 207 aa14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Kiaa1328Q6NZK5 612 aa14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Tmem94Q7TSH8 1360 aa14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 TrdnE9Q9K5 693 aa14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Map3k7clP58500 142 aa14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Specc1lQ2KN98 1118 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Tsga10Q6NY15 697 aa14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Gucy1a3Q9ERL9 691 aa14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Gnat2P50149 354 aa14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Nlrp2Q4PLS0 1046 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Elf2Q9JHC9 593 aa14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Gbp2Q9Z0E6 589 aa14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 VimP20152 466 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Cabp5Q9JLK3 173 aa14.6□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Btn2a2A4QPC6 514 aa14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Znf568E9PYI1 671 aa14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Wdr93Q402B2 695 aa14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Myl6bQ8CI43 207 aa14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Grin2aP35436 1464 aa14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Ankrd50F7BE84 1390 aa14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Tex13c2A0A0G2JGA3 530 aa14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Kifc2O08672 792 aa14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Clec11aO88200 328 aa14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Caprin2Q05A80 1031 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Ccdc114Q3UX62 658 aa14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Pla2g4fQ50L41 855 aa14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Ccdc57Q6PHN1 1016 aa14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Calcoco1Q8CGU1 691 aa14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Npc1-201ENSMUST00000025279 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.5 ms