RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD55Q3KP44 614 aa13.26□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF561Q8N587 486 aa13.26□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 POC1AQ8NBT0 407 aa13.26□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 SLC46A1Q96NT5 459 aa13.26□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 NRSN2Q9GZP1 204 aa13.26□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 LMAN1LQ9HAT1 526 aa13.26□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 PRR13Q9NZ81 148 aa13.26□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 CA14Q9ULX7 337 aa13.26□□□□□ -0.29
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TOP3B-206ENST00000436282 TRAV20A0A0B4J274 112 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 C17orf51A8MQB3 221 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 AGPAT2O15120 278 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 NPIPB7O75200 414 aa13.25□□□□□ -0.29
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TOP3B-206ENST00000436282 H2BFMP0C1H6 154 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
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TOP3B-206ENST00000436282 HMGN3Q15651 99 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 PCK2Q16822 640 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 ETV3LQ6ZN32 361 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 SLC39A7Q92504 469 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 TSLPQ969D9 159 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 SCGB3A2Q96PL1 93 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 NICN1Q9BSH3 213 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 C10orf142B7Z368 130 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV3-19P01714 112 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 MT-ND4LP03901 98 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 CD38P28907 300 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 EIF1P41567 113 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 SLC26A5P58743 744 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 IL15RAQ13261 267 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 EBPQ15125 230 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 AKIRIN2Q53H80 203 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 C1orf140Q5VVS0 124 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 COX15Q7KZN9 410 aa13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 SPAG17Q6Q759 2223 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 ADH6P28332 368 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 FASLGP48023 281 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 DNM1P34Q6PK57 102 aa13.24□□□□□ -0.29
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TOP3B-206ENST00000436282 ANGPTL5Q86XS5 388 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 KDM8Q8N371 416 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 AKR1E2Q96JD6 320 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 LPAR5Q9H1C0 372 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 CENPMQ9NSP4 180 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 FAM206AQ9NX38 181 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 PCDH15Q96QU1 1955 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 A8MVM7 634 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 SYT7O43581 403 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF217O75362 1048 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 TTRP02766 147 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM268Q5VZI3 342 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF101Q8IZC7 436 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 OR13C9Q8NGT0 318 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 OR51M1Q9H341 326 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 RPS10P5Q9NQ39 176 aa13.24□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 A0A0A6YYD4 124 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 CST4P01036 141 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 HKR1P10072 659 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 NME1P15531 152 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 PI3P19957 117 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 S100A10P60903 97 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZRG5 221 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 Q7L0L9 218 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 SYT13Q7L8C5 426 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 OR5D14Q8NGL3 314 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 RNF133Q8WVZ7 376 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 RAB3CQ96E17 227 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 UNC13CQ8NB66 2214 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 IL12BP29460 328 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 PMELP40967 661 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 AKR1C3P42330 323 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 GABRA4P48169 554 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 CLDN6P56747 220 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 FMODQ06828 376 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 FABP9Q0Z7S8 132 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 PLAC9Q5JTB6 97 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF529Q6P280 563 aa13.23□□□□□ -0.29
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM151BQ8IW70 566 aa13.23□□□□□ -0.29
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