RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312492.2

HOXC5-201, Transcript of homeobox C5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC5, Length 1,805 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5-201ENST00000312492 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 CIB4A0PJX0 185 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 CCNOP22674 350 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 STOMP27105 288 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 GDNFP39905 211 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 GPR176Q14439 515 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 PLET1Q6UQ28 207 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 DKK4Q9UBT3 224 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 RAB22AQ9UL26 194 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC5-201ENST00000312492 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 C5orf49A4QMS7 147 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 ORC5O43913 435 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 KDM4BO94953 1096 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 PRF1P14222 555 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 TGFBR3Q03167 851 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 PMPCAQ10713 525 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 UBE2V2Q15819 145 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 TBR1Q16650 682 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 GSG1Q2KHT4 349 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 OR10K2Q6IF99 312 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 BIVMQ86UB2 503 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 DOCK7Q96N67 2140 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 A0A0A6YYH2 397 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 A6NJ64 397 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 PTHLHP12272 177 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 EDN3P14138 238 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 ACKR3P25106 362 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 NPRL2Q8WTW4 380 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 ITPKCQ96DU7 683 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 GAL3ST1Q99999 423 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 NLKQ9UBE8 527 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 FAM157BP0CG42 384 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 VSIG8P0DPA2 414 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 IGHV1-2P23083 117 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 OR3A4PP47883 348 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 AP3S2P59780 193 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF92Q03936 586 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 DYRK1AQ13627 763 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 KISS1Q15726 138 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 Q6ZT83 130 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 NEK6Q9HC98 313 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 FBLN5Q9UBX5 448 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 URB1O60287 2271 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 GSTT2BP0CG30 244 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 UBBP0CG47 229 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 CCL2P13500 99 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 APLNRP35414 380 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 GSK3AP49840 483 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 PER3P56645 1201 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 TMPRSS3P57727 454 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 QRFPP83859 136 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 FAM3AP98173 230 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 UNC119Q13432 240 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 KRTCAP3Q53RY4 240 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 VWA1Q6PCB0 445 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 RNF144BQ7Z419 303 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 EXTL1Q92935 676 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 FAM46BQ96A09 425 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 SPSB4Q96A44 273 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 GPR173Q9NS66 373 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 FRYQ5TBA9 3013 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 WDR1O75083 606 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 RAD51DO75771 328 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC5-201ENST00000312492 SCGNO76038 276 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.3 ms