RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267970.8

TSPAN3-201, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN3, Length 6,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-201ENST00000267970 BTBD17A6NE02 478 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 EIF1P41567 113 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 YPEL5P62699 121 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 PPIAP62937 165 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 E5RGE8 158 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 GGNBP1Q5YKI7 109 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 NHLRC1Q6VVB1 395 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 C16orf52Q8NHV5 167 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 EDAQ92838 391 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 HDAC8Q9BY41 377 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 NSG2Q9Y328 171 aa15.19■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 A0A1B0GTH9 108 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 HSBP1O75506 76 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 RBP4P02753 201 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ADPRHP54922 357 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 BAP18Q8IXM2 172 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC37A1P57057 533 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 RTL8BQ17RB0 113 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 TCTN1Q2MV58 587 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 PRRT4C9JH25 899 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 SPRY3O43610 288 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 EDIL3O43854 480 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 MT-ATP6P00846 226 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.029e-7■□□□□ 9.8
TSPAN3-201ENST00000267970 MOGAT2Q3SYC2 334 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ADGRG3Q86Y34 549 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 KLHDC1Q8N7A1 406 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 C2orf50Q96LR7 162 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 SPNS1Q9H2V7 528 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 KRASP01116 189 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 KIR2DS4P43632 304 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 KIR2DS1Q14954 304 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 LDLRAD1Q5T700 205 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 S1PR3Q99500 378 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 OR5K3A6NET4 321 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 THEM4Q5T1C6 240 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 FAM24BQ8N5W8 94 aa15.18■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 CCDC187A0A096LP49 1063 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 OR2M5A3KFT3 312 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 PRSS37A4D1T9 235 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 J3KRW8 73 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ACSM4P0C7M7 580 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ERVS71-1P61550 626 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 C5orf46Q6UWT4 87 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 TAAR5O14804 337 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 FA2HQ7L5A8 372 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 FAM26EQ8N5C1 309 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 TMEM178AQ8NBL3 297 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ANGPTL6Q8NI99 470 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 MISP3Q96FF7 219 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ADGRG7Q96K78 797 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 GABARAPL3Q9BY60 117 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC6A13Q9NSD5 602 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 A0A1B0GTQ1 180 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 WNT1P04628 370 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 CLDN15P56746 228 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 SMIM19Q96E16 107 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 MGMTP16455 207 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 NCMAPQ5T1S8 102 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ZADH2Q8N4Q0 377 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 COMMD5Q9GZQ3 224 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 EVA1AQ9H8M9 152 aa15.17■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 UPK1AO00322 258 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 POU2F2P09086 479 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 OR5AL1P0C617 328 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 TCTN3Q6NUS6 607 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 MOB3BQ86TA1 216 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 PPM1DO15297 605 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 IGHV3-43DP0DP04 118 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 CCL2P13500 99 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ERHP84090 104 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 TXNIPQ9H3M7 391 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 R4GMQ9 66 aa15.16■□□□□ 0.02
TSPAN3-201ENST00000267970 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms