RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		9.84	□□□□□ -0.83
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	ARPC3	O15145	178 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A2	O15244	555 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	SASH3	O75995	380 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	REN	P00797	406 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	COX4I1	P13073	169 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	RHCE	P18577	417 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC6A6	P31641	620 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	DLX1	P56177	255 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	TPTE	P56180	551 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNJ8	Q15842	424 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	RFX4	Q33E94	735 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR86	Q86TI4	376 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	LNX2	Q8N448	690 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	ST8SIA4	Q92187	359 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A4	Q9H015	551 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338		A6NLC8	198 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	GMDS	O60547	372 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	LHB	P01229	141 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	HLA-DQA2	P01906	255 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	GRP	P07492	148 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC2A1	P11166	492 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	PYCR1	P32322	319 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	PCK2	Q16822	640 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC36A3	Q495N2	470 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	CDON	Q4KMG0	1287 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	SEH1L	Q96EE3	360 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	IFT27	Q9BW83	186 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338		V9GYQ6	96 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	PLXNB1	O43157	2135 aa		9.82	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	GGT3P	A6NGU5	568 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	TVP23A	A6NH52	213 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFA2	O43678	99 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	SEMG1	P04279	462 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	NUDT2	P50583	147 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	CSNK2B	P67870	215 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	KLRD1	Q13241	179 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR38	Q5JTN6	314 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	HDX	Q7Z353	690 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	SPTSSA	Q969W0	71 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	CCL13	Q99616	98 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	C16orf95	Q9H693	158 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	KPTN	Q9Y664	436 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		9.81	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GVI7	797 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	BHLHE40	O14503	412 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	SELL	P14151	372 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	AMY2B	P19961	511 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	NOS3	P29474	1203 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	GSS	P48637	474 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKX	P51817	358 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	SPIB	Q01892	262 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	EGR3	Q06889	387 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	DRAM2	Q6UX65	266 aa		9.8	□□□□□ -0.84
TTLL3-233	ENST00000602338	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		9.8	□□□□□ -0.84

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