RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 S100A8P05109 93 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 GP1BAP07359 652 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 UBBP0CG47 229 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SMIM6P0DI80 62 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 CD37P11049 281 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ERGP11308 486 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 MGMTP16455 207 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SPI1P17947 270 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 CELP19835 753 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SHC1P29353 583 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 MEOX2P50222 304 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 PAX9P55771 341 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 UBA52P62987 128 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SGCGQ13326 291 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 PLD1Q13393 1074 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TMEM187Q14656 261 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 PGGHGQ32M88 737 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 OR4C11Q6IEV9 310 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ADNP2Q6IQ32 1131 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 MED27Q6P2C8 311 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 AGTRAPQ6RW13 159 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 FAM151BQ6UXP7 276 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ZNF620Q6ZNG0 422 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 LINC00696Q6ZRV3 163 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TMUB2Q71RG4 321 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SLC24A5Q71RS6 500 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SERINC5Q86VE9 423 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 COMTD1Q86VU5 262 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TMEM17Q86X19 198 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SKA3Q8IX90 412 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SYS1Q8N2H4 156 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 PRSS35Q8N3Z0 413 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 RNF175Q8N4F7 328 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ACBD7Q8N6N7 88 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 OR6C4Q8NGE1 309 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 OR4D10Q8NGI6 311 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 OR4Q3Q8NH05 313 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SFXN5Q8TD22 340 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SMPDL3AQ92484 453 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 OSTF1Q92882 214 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 UBE2E3Q969T4 207 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 WFDC6Q9BQY6 131 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TM6SF2Q9BZW4 377 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 HDHD2Q9H0R4 259 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 UBQLN3Q9H347 655 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SGK2Q9HBY8 427 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 BIN3Q9NQY0 253 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 CACNG5Q9UF02 275 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 RASD1Q9Y272 281 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 NUP210LQ5VU65 1888 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TRAV6A0A075B6T7 132 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 A0A0D9SG52 128 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 A0A0U1RQK1 487 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GTI1 187 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PR80 420 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 TSPAN11A1L157 253 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ZNF320A2RRD8 509 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 RFPL4AA6NLU0 287 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 C15orf61A6NNL5 157 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 WASH3PC4AMC7 463 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 GATCO43716 136 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 STX11O75558 287 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ATG12O94817 140 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 OR5F1O95221 314 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SERPINA3P01011 423 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ALDOBP05062 364 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 IL3P08700 152 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 IFI6P09912 130 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 CALCBP10092 127 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SLC25A4P12235 298 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ATF1P18846 271 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 RAB3BP20337 219 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 NT5EP21589 574 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SLC2A5P22732 501 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 DPP4P27487 766 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 RABIFP47224 123 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 OR3A1P47881 315 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 OR3A2P47893 321 aa4.24□□□□□ -1.73
TRDN-204ENST00000542443 SPINT3P49223 89 aa4.24□□□□□ -1.73
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